Protein–RNA interactions for Protein: P35822

Ptprk, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, mousemouse

Predictions only

Length 1,457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprkP35822 Tpd52l1-205ENSMUST00000215515 857 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PtprkP35822 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PtprkP35822 Tas2r137-201ENSMUST00000064932 1073 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PtprkP35822 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PtprkP35822 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PtprkP35822 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PtprkP35822 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PtprkP35822 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PtprkP35822 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PtprkP35822 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PtprkP35822 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PtprkP35822 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PtprkP35822 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PtprkP35822 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PtprkP35822 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PtprkP35822 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PtprkP35822 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PtprkP35822 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PtprkP35822 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PtprkP35822 0610037L13Rik-205ENSMUST00000119394 741 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PtprkP35822 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PtprkP35822 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
PtprkP35822 Gm43758-201ENSMUST00000199500 367 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
PtprkP35822 Gm19309-201ENSMUST00000218295 205 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
PtprkP35822 Olfr686-201ENSMUST00000050157 1018 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PtprkP35822 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PtprkP35822 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PtprkP35822 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PtprkP35822 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PtprkP35822 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PtprkP35822 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PtprkP35822 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PtprkP35822 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PtprkP35822 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PtprkP35822 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PtprkP35822 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PtprkP35822 Hnf4aos-203ENSMUST00000141329 839 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PtprkP35822 Gm43118-201ENSMUST00000199149 775 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
PtprkP35822 AC164573.1-201ENSMUST00000218616 963 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PtprkP35822 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PtprkP35822 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PtprkP35822 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PtprkP35822 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PtprkP35822 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PtprkP35822 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PtprkP35822 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PtprkP35822 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PtprkP35822 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PtprkP35822 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PtprkP35822 4933406I18Rik-201ENSMUST00000124673 905 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PtprkP35822 Gm11772-201ENSMUST00000136542 532 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PtprkP35822 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
PtprkP35822 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PtprkP35822 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
PtprkP35822 Gm2164-201ENSMUST00000184062 424 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PtprkP35822 Gm45881-201ENSMUST00000210659 517 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PtprkP35822 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
PtprkP35822 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PtprkP35822 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PtprkP35822 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PtprkP35822 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PtprkP35822 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PtprkP35822 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PtprkP35822 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PtprkP35822 Gm38002-201ENSMUST00000193255 180 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
PtprkP35822 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PtprkP35822 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
PtprkP35822 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PtprkP35822 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PtprkP35822 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PtprkP35822 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PtprkP35822 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PtprkP35822 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PtprkP35822 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PtprkP35822 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PtprkP35822 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
PtprkP35822 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PtprkP35822 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PtprkP35822 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PtprkP35822 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
PtprkP35822 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PtprkP35822 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PtprkP35822 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
PtprkP35822 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PtprkP35822 Gm27501-201ENSMUST00000183599 107 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
PtprkP35822 Gm28380-201ENSMUST00000188800 385 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PtprkP35822 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PtprkP35822 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PtprkP35822 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PtprkP35822 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PtprkP35822 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PtprkP35822 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PtprkP35822 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PtprkP35822 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PtprkP35822 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PtprkP35822 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PtprkP35822 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PtprkP35822 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PtprkP35822 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PtprkP35822 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms