Protein–RNA interactions for Protein: P35396

Ppard, Peroxisome proliferator-activated receptor delta, mousemouse

Predictions only

Length 440 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PpardP35396 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PpardP35396 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PpardP35396 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PpardP35396 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PpardP35396 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PpardP35396 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PpardP35396 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PpardP35396 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PpardP35396 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PpardP35396 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PpardP35396 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PpardP35396 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PpardP35396 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PpardP35396 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PpardP35396 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PpardP35396 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PpardP35396 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PpardP35396 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PpardP35396 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PpardP35396 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PpardP35396 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PpardP35396 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PpardP35396 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PpardP35396 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PpardP35396 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PpardP35396 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PpardP35396 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PpardP35396 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
PpardP35396 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PpardP35396 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PpardP35396 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
PpardP35396 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PpardP35396 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PpardP35396 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PpardP35396 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PpardP35396 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PpardP35396 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PpardP35396 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PpardP35396 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PpardP35396 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PpardP35396 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PpardP35396 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PpardP35396 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PpardP35396 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PpardP35396 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PpardP35396 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PpardP35396 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PpardP35396 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PpardP35396 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PpardP35396 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PpardP35396 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PpardP35396 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PpardP35396 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PpardP35396 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PpardP35396 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PpardP35396 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PpardP35396 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PpardP35396 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
PpardP35396 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PpardP35396 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PpardP35396 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PpardP35396 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PpardP35396 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PpardP35396 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PpardP35396 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PpardP35396 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PpardP35396 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
PpardP35396 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PpardP35396 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PpardP35396 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PpardP35396 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PpardP35396 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PpardP35396 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PpardP35396 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PpardP35396 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PpardP35396 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PpardP35396 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PpardP35396 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PpardP35396 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PpardP35396 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PpardP35396 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PpardP35396 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PpardP35396 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
PpardP35396 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PpardP35396 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PpardP35396 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PpardP35396 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PpardP35396 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PpardP35396 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
PpardP35396 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PpardP35396 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PpardP35396 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PpardP35396 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
PpardP35396 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PpardP35396 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PpardP35396 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PpardP35396 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PpardP35396 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PpardP35396 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PpardP35396 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.1 ms