Protein–RNA interactions for Protein: P33215

Nedd1, Protein NEDD1, mousemouse

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nedd1P33215 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nedd1P33215 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Nedd1P33215 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nedd1P33215 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nedd1P33215 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nedd1P33215 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nedd1P33215 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nedd1P33215 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nedd1P33215 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nedd1P33215 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Nedd1P33215 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nedd1P33215 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nedd1P33215 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nedd1P33215 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nedd1P33215 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nedd1P33215 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nedd1P33215 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nedd1P33215 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nedd1P33215 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nedd1P33215 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nedd1P33215 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nedd1P33215 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nedd1P33215 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nedd1P33215 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nedd1P33215 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Nedd1P33215 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nedd1P33215 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nedd1P33215 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nedd1P33215 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nedd1P33215 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Nedd1P33215 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nedd1P33215 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nedd1P33215 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nedd1P33215 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nedd1P33215 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nedd1P33215 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nedd1P33215 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nedd1P33215 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nedd1P33215 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nedd1P33215 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nedd1P33215 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nedd1P33215 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nedd1P33215 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nedd1P33215 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nedd1P33215 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nedd1P33215 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nedd1P33215 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nedd1P33215 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nedd1P33215 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nedd1P33215 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nedd1P33215 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nedd1P33215 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nedd1P33215 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nedd1P33215 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nedd1P33215 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nedd1P33215 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nedd1P33215 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nedd1P33215 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nedd1P33215 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nedd1P33215 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nedd1P33215 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nedd1P33215 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nedd1P33215 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nedd1P33215 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nedd1P33215 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nedd1P33215 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nedd1P33215 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nedd1P33215 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nedd1P33215 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nedd1P33215 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nedd1P33215 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nedd1P33215 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nedd1P33215 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Nedd1P33215 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nedd1P33215 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nedd1P33215 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nedd1P33215 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nedd1P33215 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nedd1P33215 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nedd1P33215 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nedd1P33215 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nedd1P33215 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nedd1P33215 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Nedd1P33215 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nedd1P33215 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nedd1P33215 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Nedd1P33215 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nedd1P33215 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Nedd1P33215 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nedd1P33215 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Nedd1P33215 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nedd1P33215 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nedd1P33215 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nedd1P33215 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nedd1P33215 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nedd1P33215 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nedd1P33215 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nedd1P33215 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nedd1P33215 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nedd1P33215 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.5 ms