Protein–RNA interactions for Protein: P31313

Hoxc11, Homeobox protein Hox-C11, mousemouse

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Length 304 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc11P31313 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Hoxc11P31313 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Hoxc11P31313 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Hoxc11P31313 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Hoxc11P31313 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Hoxc11P31313 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Hoxc11P31313 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Hoxc11P31313 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Hoxc11P31313 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Hoxc11P31313 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Hoxc11P31313 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Hoxc11P31313 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Hoxc11P31313 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Hoxc11P31313 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Hoxc11P31313 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Hoxc11P31313 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Hoxc11P31313 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Hoxc11P31313 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Hoxc11P31313 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Hoxc11P31313 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Hoxc11P31313 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Hoxc11P31313 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Hoxc11P31313 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Hoxc11P31313 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Hoxc11P31313 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Hoxc11P31313 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Hoxc11P31313 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Hoxc11P31313 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Hoxc11P31313 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Hoxc11P31313 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Hoxc11P31313 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Hoxc11P31313 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Hoxc11P31313 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Hoxc11P31313 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Hoxc11P31313 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Hoxc11P31313 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Hoxc11P31313 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Hoxc11P31313 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Hoxc11P31313 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Hoxc11P31313 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Hoxc11P31313 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Hoxc11P31313 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Hoxc11P31313 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Hoxc11P31313 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Hoxc11P31313 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Hoxc11P31313 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Hoxc11P31313 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Hoxc11P31313 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Hoxc11P31313 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Hoxc11P31313 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Hoxc11P31313 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Hoxc11P31313 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Hoxc11P31313 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Hoxc11P31313 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Hoxc11P31313 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Hoxc11P31313 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Hoxc11P31313 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Hoxc11P31313 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Hoxc11P31313 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Hoxc11P31313 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Hoxc11P31313 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Hoxc11P31313 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Hoxc11P31313 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Hoxc11P31313 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Hoxc11P31313 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Hoxc11P31313 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Hoxc11P31313 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Hoxc11P31313 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Hoxc11P31313 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Hoxc11P31313 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Hoxc11P31313 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Hoxc11P31313 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Hoxc11P31313 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Hoxc11P31313 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Hoxc11P31313 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Hoxc11P31313 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Hoxc11P31313 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Hoxc11P31313 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Hoxc11P31313 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Hoxc11P31313 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Hoxc11P31313 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Hoxc11P31313 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Hoxc11P31313 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Hoxc11P31313 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Hoxc11P31313 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Hoxc11P31313 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Hoxc11P31313 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Hoxc11P31313 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Hoxc11P31313 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Hoxc11P31313 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Hoxc11P31313 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Hoxc11P31313 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Hoxc11P31313 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Hoxc11P31313 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Hoxc11P31313 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Hoxc11P31313 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Hoxc11P31313 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Hoxc11P31313 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Hoxc11P31313 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Hoxc11P31313 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
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