Protein–RNA interactions for Protein: P29341

Pabpc1, Polyadenylate-binding protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 636 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pabpc1P29341 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pabpc1P29341 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Pabpc1P29341 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pabpc1P29341 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pabpc1P29341 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pabpc1P29341 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pabpc1P29341 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pabpc1P29341 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pabpc1P29341 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pabpc1P29341 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Pabpc1P29341 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC14.71□□□□□ -0.06
Pabpc1P29341 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Pabpc1P29341 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Pabpc1P29341 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Pabpc1P29341 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Pabpc1P29341 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Pabpc1P29341 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pabpc1P29341 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pabpc1P29341 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pabpc1P29341 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pabpc1P29341 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pabpc1P29341 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pabpc1P29341 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pabpc1P29341 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pabpc1P29341 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pabpc1P29341 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pabpc1P29341 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pabpc1P29341 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pabpc1P29341 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pabpc1P29341 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pabpc1P29341 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pabpc1P29341 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pabpc1P29341 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Pabpc1P29341 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pabpc1P29341 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pabpc1P29341 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pabpc1P29341 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pabpc1P29341 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pabpc1P29341 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pabpc1P29341 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pabpc1P29341 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pabpc1P29341 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pabpc1P29341 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pabpc1P29341 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pabpc1P29341 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pabpc1P29341 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pabpc1P29341 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pabpc1P29341 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pabpc1P29341 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pabpc1P29341 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pabpc1P29341 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pabpc1P29341 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pabpc1P29341 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pabpc1P29341 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pabpc1P29341 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pabpc1P29341 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Pabpc1P29341 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pabpc1P29341 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pabpc1P29341 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pabpc1P29341 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Pabpc1P29341 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pabpc1P29341 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pabpc1P29341 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pabpc1P29341 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pabpc1P29341 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pabpc1P29341 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pabpc1P29341 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pabpc1P29341 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pabpc1P29341 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pabpc1P29341 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pabpc1P29341 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pabpc1P29341 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pabpc1P29341 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pabpc1P29341 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pabpc1P29341 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pabpc1P29341 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pabpc1P29341 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pabpc1P29341 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pabpc1P29341 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pabpc1P29341 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pabpc1P29341 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pabpc1P29341 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pabpc1P29341 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pabpc1P29341 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pabpc1P29341 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pabpc1P29341 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pabpc1P29341 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pabpc1P29341 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pabpc1P29341 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pabpc1P29341 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pabpc1P29341 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pabpc1P29341 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pabpc1P29341 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pabpc1P29341 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Pabpc1P29341 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pabpc1P29341 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pabpc1P29341 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pabpc1P29341 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pabpc1P29341 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pabpc1P29341 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms