Protein–RNA interactions for Protein: P28700

Rxra, Retinoic acid receptor RXR-alpha, mousemouse

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Length 467 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxraP28700 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
RxraP28700 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
RxraP28700 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
RxraP28700 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
RxraP28700 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
RxraP28700 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC14.45□□□□□ -0.1
RxraP28700 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
RxraP28700 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
RxraP28700 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
RxraP28700 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
RxraP28700 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
RxraP28700 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
RxraP28700 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
RxraP28700 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
RxraP28700 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC14.45□□□□□ -0.1
RxraP28700 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
RxraP28700 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC14.45□□□□□ -0.1
RxraP28700 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
RxraP28700 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
RxraP28700 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
RxraP28700 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
RxraP28700 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
RxraP28700 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
RxraP28700 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
RxraP28700 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
RxraP28700 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
RxraP28700 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
RxraP28700 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
RxraP28700 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
RxraP28700 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
RxraP28700 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC14.44□□□□□ -0.1
RxraP28700 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
RxraP28700 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
RxraP28700 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
RxraP28700 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
RxraP28700 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
RxraP28700 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
RxraP28700 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
RxraP28700 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
RxraP28700 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
RxraP28700 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC14.44□□□□□ -0.1
RxraP28700 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
RxraP28700 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
RxraP28700 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC14.44□□□□□ -0.1
RxraP28700 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
RxraP28700 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
RxraP28700 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
RxraP28700 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
RxraP28700 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
RxraP28700 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
RxraP28700 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
RxraP28700 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
RxraP28700 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
RxraP28700 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC14.44□□□□□ -0.1
RxraP28700 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
RxraP28700 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
RxraP28700 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
RxraP28700 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
RxraP28700 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
RxraP28700 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
RxraP28700 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
RxraP28700 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC14.43□□□□□ -0.1
RxraP28700 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
RxraP28700 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
RxraP28700 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
RxraP28700 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
RxraP28700 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
RxraP28700 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC14.43□□□□□ -0.1
RxraP28700 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
RxraP28700 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
RxraP28700 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
RxraP28700 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
RxraP28700 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
RxraP28700 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
RxraP28700 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
RxraP28700 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
RxraP28700 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
RxraP28700 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC14.43□□□□□ -0.1
RxraP28700 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
RxraP28700 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC14.43□□□□□ -0.1
RxraP28700 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
RxraP28700 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
RxraP28700 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
RxraP28700 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
RxraP28700 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
RxraP28700 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC14.43□□□□□ -0.1
RxraP28700 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
RxraP28700 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC14.43□□□□□ -0.1
RxraP28700 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
RxraP28700 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC14.43□□□□□ -0.1
RxraP28700 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
RxraP28700 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC14.43□□□□□ -0.1
RxraP28700 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC14.43□□□□□ -0.1
RxraP28700 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC14.43□□□□□ -0.1
RxraP28700 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
RxraP28700 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
RxraP28700 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
RxraP28700 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
RxraP28700 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
RxraP28700 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
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