Protein–RNA interactions for Protein: P28654

Dcn, Decorin, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DcnP28654 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.31
DcnP28654 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.31
DcnP28654 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
DcnP28654 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
DcnP28654 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
DcnP28654 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
DcnP28654 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
DcnP28654 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
DcnP28654 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
DcnP28654 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
DcnP28654 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
DcnP28654 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
DcnP28654 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
DcnP28654 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
DcnP28654 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
DcnP28654 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
DcnP28654 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
DcnP28654 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
DcnP28654 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
DcnP28654 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
DcnP28654 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
DcnP28654 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
DcnP28654 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
DcnP28654 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
DcnP28654 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
DcnP28654 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
DcnP28654 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
DcnP28654 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
DcnP28654 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
DcnP28654 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
DcnP28654 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
DcnP28654 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
DcnP28654 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
DcnP28654 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
DcnP28654 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
DcnP28654 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
DcnP28654 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
DcnP28654 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
DcnP28654 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
DcnP28654 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
DcnP28654 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
DcnP28654 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
DcnP28654 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
DcnP28654 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
DcnP28654 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
DcnP28654 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
DcnP28654 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
DcnP28654 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
DcnP28654 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
DcnP28654 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
DcnP28654 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
DcnP28654 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
DcnP28654 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
DcnP28654 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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DcnP28654 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
DcnP28654 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
DcnP28654 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
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DcnP28654 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
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DcnP28654 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
DcnP28654 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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DcnP28654 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
DcnP28654 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
DcnP28654 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
DcnP28654 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
DcnP28654 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
DcnP28654 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
DcnP28654 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
DcnP28654 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
DcnP28654 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
DcnP28654 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
DcnP28654 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
DcnP28654 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
DcnP28654 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
DcnP28654 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
DcnP28654 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
DcnP28654 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
DcnP28654 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
DcnP28654 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
DcnP28654 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
DcnP28654 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
DcnP28654 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
DcnP28654 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
DcnP28654 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
DcnP28654 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
DcnP28654 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
DcnP28654 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
DcnP28654 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
DcnP28654 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
DcnP28654 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
DcnP28654 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms