Protein–RNA interactions for Protein: P28309

Defa2, Alpha-defensin 2, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa2P28309 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Defa2P28309 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Defa2P28309 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Defa2P28309 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Defa2P28309 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Defa2P28309 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Defa2P28309 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Defa2P28309 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Defa2P28309 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Defa2P28309 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Defa2P28309 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Defa2P28309 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Defa2P28309 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Defa2P28309 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Defa2P28309 Ltbp2-202ENSMUST00000110254 6602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Defa2P28309 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Defa2P28309 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Defa2P28309 Speg-201ENSMUST00000087122 10801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Defa2P28309 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Defa2P28309 Rsbn1l-202ENSMUST00000196780 7651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Defa2P28309 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Defa2P28309 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Defa2P28309 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Defa2P28309 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Defa2P28309 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Defa2P28309 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Defa2P28309 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Defa2P28309 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Defa2P28309 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Defa2P28309 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Defa2P28309 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Defa2P28309 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Defa2P28309 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Defa2P28309 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Defa2P28309 Elmsan1-201ENSMUST00000046266 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Defa2P28309 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Defa2P28309 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Defa2P28309 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Defa2P28309 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Defa2P28309 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Defa2P28309 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Defa2P28309 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Defa2P28309 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Defa2P28309 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Defa2P28309 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Defa2P28309 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Defa2P28309 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Defa2P28309 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Defa2P28309 Fnip2-203ENSMUST00000133154 7299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Defa2P28309 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Defa2P28309 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Defa2P28309 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Defa2P28309 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Defa2P28309 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Defa2P28309 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Defa2P28309 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Defa2P28309 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Defa2P28309 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Defa2P28309 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Defa2P28309 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Defa2P28309 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Defa2P28309 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Defa2P28309 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Defa2P28309 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Defa2P28309 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Defa2P28309 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Defa2P28309 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Defa2P28309 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Defa2P28309 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Defa2P28309 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Defa2P28309 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Defa2P28309 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Defa2P28309 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Defa2P28309 Kcnj5-201ENSMUST00000034533 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Defa2P28309 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Defa2P28309 Igfn1-203ENSMUST00000166193 8989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Defa2P28309 Samd4-201ENSMUST00000022386 4564 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Defa2P28309 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Defa2P28309 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Defa2P28309 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Defa2P28309 Palld-204ENSMUST00000121785 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Defa2P28309 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Defa2P28309 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Defa2P28309 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Defa2P28309 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Defa2P28309 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Defa2P28309 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Defa2P28309 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Defa2P28309 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Defa2P28309 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Defa2P28309 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Defa2P28309 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Defa2P28309 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Defa2P28309 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Defa2P28309 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Defa2P28309 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Defa2P28309 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Defa2P28309 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Defa2P28309 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Defa2P28309 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76 ms