Protein–RNA interactions for Protein: P27870

Vav1, Proto-oncogene vav, mousemouse

Predictions only

Length 845 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vav1P27870 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Vav1P27870 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Vav1P27870 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Vav1P27870 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Vav1P27870 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Vav1P27870 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Vav1P27870 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Vav1P27870 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Vav1P27870 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Vav1P27870 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Vav1P27870 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Vav1P27870 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Vav1P27870 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Vav1P27870 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Vav1P27870 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Vav1P27870 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Vav1P27870 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Vav1P27870 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Vav1P27870 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Vav1P27870 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Vav1P27870 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Vav1P27870 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Vav1P27870 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Vav1P27870 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Vav1P27870 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Vav1P27870 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Vav1P27870 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Vav1P27870 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Vav1P27870 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Vav1P27870 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Vav1P27870 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Vav1P27870 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Vav1P27870 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Vav1P27870 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Vav1P27870 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Vav1P27870 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Vav1P27870 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Vav1P27870 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Vav1P27870 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Vav1P27870 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Vav1P27870 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Vav1P27870 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Vav1P27870 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Vav1P27870 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Vav1P27870 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Vav1P27870 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Vav1P27870 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Vav1P27870 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Vav1P27870 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
Vav1P27870 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Vav1P27870 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Vav1P27870 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Vav1P27870 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Vav1P27870 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Vav1P27870 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Vav1P27870 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Vav1P27870 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Vav1P27870 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Vav1P27870 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Vav1P27870 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Vav1P27870 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Vav1P27870 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Vav1P27870 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Vav1P27870 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Vav1P27870 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Vav1P27870 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Vav1P27870 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Vav1P27870 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Vav1P27870 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Vav1P27870 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Vav1P27870 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Vav1P27870 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Vav1P27870 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Vav1P27870 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Vav1P27870 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Vav1P27870 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Vav1P27870 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Vav1P27870 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Vav1P27870 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Vav1P27870 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Vav1P27870 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Vav1P27870 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Vav1P27870 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Vav1P27870 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Vav1P27870 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Vav1P27870 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Vav1P27870 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Vav1P27870 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Vav1P27870 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Vav1P27870 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Vav1P27870 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Vav1P27870 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Vav1P27870 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Vav1P27870 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Vav1P27870 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Vav1P27870 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Vav1P27870 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Vav1P27870 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Vav1P27870 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Vav1P27870 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.2 ms