Protein–RNA interactions for Protein: P27661

H2afx, Histone H2AX, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 143 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2afxP27661 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
H2afxP27661 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
H2afxP27661 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
H2afxP27661 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
H2afxP27661 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
H2afxP27661 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
H2afxP27661 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
H2afxP27661 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
H2afxP27661 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
H2afxP27661 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
H2afxP27661 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
H2afxP27661 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
H2afxP27661 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
H2afxP27661 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
H2afxP27661 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
H2afxP27661 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
H2afxP27661 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
H2afxP27661 Armcx1-201ENSMUST00000035748 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
H2afxP27661 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
H2afxP27661 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
H2afxP27661 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
H2afxP27661 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
H2afxP27661 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
H2afxP27661 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC15.06■□□□□ 0
H2afxP27661 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
H2afxP27661 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
H2afxP27661 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
H2afxP27661 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
H2afxP27661 Astl-204ENSMUST00000179618 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
H2afxP27661 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
H2afxP27661 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
H2afxP27661 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
H2afxP27661 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
H2afxP27661 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
H2afxP27661 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
H2afxP27661 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
H2afxP27661 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
H2afxP27661 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
H2afxP27661 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
H2afxP27661 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
H2afxP27661 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
H2afxP27661 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
H2afxP27661 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
H2afxP27661 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
H2afxP27661 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
H2afxP27661 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
H2afxP27661 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
H2afxP27661 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
H2afxP27661 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
H2afxP27661 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
H2afxP27661 Dph2-201ENSMUST00000030265 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
H2afxP27661 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
H2afxP27661 Fam160a2-202ENSMUST00000074686 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
H2afxP27661 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
H2afxP27661 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
H2afxP27661 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
H2afxP27661 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC15.05■□□□□ -0
H2afxP27661 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
H2afxP27661 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
H2afxP27661 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
H2afxP27661 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
H2afxP27661 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
H2afxP27661 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
H2afxP27661 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
H2afxP27661 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
H2afxP27661 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
H2afxP27661 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC15.05■□□□□ -0
H2afxP27661 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
H2afxP27661 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
H2afxP27661 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
H2afxP27661 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
H2afxP27661 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
H2afxP27661 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
H2afxP27661 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
H2afxP27661 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
H2afxP27661 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
H2afxP27661 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
H2afxP27661 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
H2afxP27661 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
H2afxP27661 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
H2afxP27661 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
H2afxP27661 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
H2afxP27661 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
H2afxP27661 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
H2afxP27661 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC15.04■□□□□ -0
H2afxP27661 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
H2afxP27661 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC15.04■□□□□ -0
H2afxP27661 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
H2afxP27661 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
H2afxP27661 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
H2afxP27661 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC15.04■□□□□ -0
H2afxP27661 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
H2afxP27661 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
H2afxP27661 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC15.04■□□□□ -0
H2afxP27661 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
H2afxP27661 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC15.04■□□□□ -0
H2afxP27661 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
H2afxP27661 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
H2afxP27661 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
H2afxP27661 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.4 ms