Protein–RNA interactions for Protein: P23607

Zfa, Zinc finger autosomal protein, mousemouse

Predictions only

Length 742 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZfaP23607 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ZfaP23607 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ZfaP23607 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ZfaP23607 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ZfaP23607 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ZfaP23607 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ZfaP23607 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ZfaP23607 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ZfaP23607 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ZfaP23607 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ZfaP23607 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ZfaP23607 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ZfaP23607 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ZfaP23607 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ZfaP23607 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ZfaP23607 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ZfaP23607 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ZfaP23607 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ZfaP23607 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ZfaP23607 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ZfaP23607 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
ZfaP23607 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ZfaP23607 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ZfaP23607 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ZfaP23607 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ZfaP23607 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ZfaP23607 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ZfaP23607 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ZfaP23607 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ZfaP23607 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ZfaP23607 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ZfaP23607 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ZfaP23607 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ZfaP23607 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ZfaP23607 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ZfaP23607 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ZfaP23607 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ZfaP23607 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ZfaP23607 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ZfaP23607 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ZfaP23607 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ZfaP23607 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ZfaP23607 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ZfaP23607 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ZfaP23607 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ZfaP23607 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ZfaP23607 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ZfaP23607 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ZfaP23607 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ZfaP23607 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ZfaP23607 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ZfaP23607 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ZfaP23607 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
ZfaP23607 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ZfaP23607 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ZfaP23607 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
ZfaP23607 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ZfaP23607 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
ZfaP23607 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ZfaP23607 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ZfaP23607 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ZfaP23607 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ZfaP23607 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ZfaP23607 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ZfaP23607 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ZfaP23607 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ZfaP23607 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ZfaP23607 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ZfaP23607 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ZfaP23607 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ZfaP23607 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ZfaP23607 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ZfaP23607 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ZfaP23607 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ZfaP23607 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ZfaP23607 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ZfaP23607 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ZfaP23607 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ZfaP23607 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ZfaP23607 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ZfaP23607 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
ZfaP23607 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
ZfaP23607 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
ZfaP23607 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
ZfaP23607 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
ZfaP23607 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
ZfaP23607 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
ZfaP23607 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ZfaP23607 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ZfaP23607 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
ZfaP23607 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ZfaP23607 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
ZfaP23607 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
ZfaP23607 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
ZfaP23607 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ZfaP23607 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ZfaP23607 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
ZfaP23607 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
ZfaP23607 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
ZfaP23607 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms