Protein–RNA interactions for Protein: P23475

Xrcc6, X-ray repair cross-complementing protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 608 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xrcc6P23475 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Xrcc6P23475 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Xrcc6P23475 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Xrcc6P23475 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Xrcc6P23475 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Xrcc6P23475 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Xrcc6P23475 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Xrcc6P23475 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Xrcc6P23475 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Xrcc6P23475 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Xrcc6P23475 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Xrcc6P23475 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Xrcc6P23475 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Xrcc6P23475 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Xrcc6P23475 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Xrcc6P23475 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Xrcc6P23475 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Xrcc6P23475 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Xrcc6P23475 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Xrcc6P23475 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Xrcc6P23475 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Xrcc6P23475 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Xrcc6P23475 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Xrcc6P23475 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Xrcc6P23475 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Xrcc6P23475 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Xrcc6P23475 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Xrcc6P23475 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Xrcc6P23475 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Xrcc6P23475 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Xrcc6P23475 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Xrcc6P23475 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Xrcc6P23475 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Xrcc6P23475 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Xrcc6P23475 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Xrcc6P23475 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Xrcc6P23475 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Xrcc6P23475 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Xrcc6P23475 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Xrcc6P23475 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Xrcc6P23475 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Xrcc6P23475 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Xrcc6P23475 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Xrcc6P23475 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Xrcc6P23475 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Xrcc6P23475 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Xrcc6P23475 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Xrcc6P23475 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Xrcc6P23475 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Xrcc6P23475 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Xrcc6P23475 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Xrcc6P23475 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Xrcc6P23475 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Xrcc6P23475 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Xrcc6P23475 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Xrcc6P23475 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Xrcc6P23475 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Xrcc6P23475 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Xrcc6P23475 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Xrcc6P23475 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Xrcc6P23475 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Xrcc6P23475 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Xrcc6P23475 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Xrcc6P23475 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Xrcc6P23475 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
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Xrcc6P23475 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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Xrcc6P23475 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Xrcc6P23475 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Xrcc6P23475 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Xrcc6P23475 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Xrcc6P23475 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Xrcc6P23475 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Xrcc6P23475 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Xrcc6P23475 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Xrcc6P23475 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Xrcc6P23475 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Xrcc6P23475 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Xrcc6P23475 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Xrcc6P23475 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Xrcc6P23475 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Xrcc6P23475 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Xrcc6P23475 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Xrcc6P23475 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Xrcc6P23475 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Xrcc6P23475 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Xrcc6P23475 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
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Xrcc6P23475 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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Xrcc6P23475 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Xrcc6P23475 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Xrcc6P23475 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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Xrcc6P23475 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Xrcc6P23475 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Xrcc6P23475 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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