Protein–RNA interactions for Protein: P23204

Ppara, Peroxisome proliferator-activated receptor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PparaP23204 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
PparaP23204 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PparaP23204 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PparaP23204 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
PparaP23204 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
PparaP23204 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
PparaP23204 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PparaP23204 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PparaP23204 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PparaP23204 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PparaP23204 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
PparaP23204 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PparaP23204 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PparaP23204 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PparaP23204 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PparaP23204 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
PparaP23204 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PparaP23204 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PparaP23204 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PparaP23204 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PparaP23204 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PparaP23204 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PparaP23204 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PparaP23204 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PparaP23204 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PparaP23204 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PparaP23204 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PparaP23204 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PparaP23204 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PparaP23204 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PparaP23204 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PparaP23204 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
PparaP23204 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PparaP23204 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PparaP23204 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
PparaP23204 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PparaP23204 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PparaP23204 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PparaP23204 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PparaP23204 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PparaP23204 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PparaP23204 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PparaP23204 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PparaP23204 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PparaP23204 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PparaP23204 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PparaP23204 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PparaP23204 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PparaP23204 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PparaP23204 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PparaP23204 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PparaP23204 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PparaP23204 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PparaP23204 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PparaP23204 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PparaP23204 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PparaP23204 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PparaP23204 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PparaP23204 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PparaP23204 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PparaP23204 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PparaP23204 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PparaP23204 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PparaP23204 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PparaP23204 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PparaP23204 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PparaP23204 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PparaP23204 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PparaP23204 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PparaP23204 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PparaP23204 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PparaP23204 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
PparaP23204 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PparaP23204 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PparaP23204 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PparaP23204 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PparaP23204 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
PparaP23204 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
PparaP23204 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PparaP23204 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PparaP23204 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PparaP23204 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PparaP23204 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PparaP23204 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PparaP23204 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PparaP23204 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PparaP23204 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PparaP23204 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PparaP23204 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PparaP23204 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PparaP23204 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PparaP23204 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PparaP23204 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
PparaP23204 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PparaP23204 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PparaP23204 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PparaP23204 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PparaP23204 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PparaP23204 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
PparaP23204 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.6 ms