Protein–RNA interactions for Protein: P20801

Tnnc2, Troponin C, skeletal muscle, mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnc2P20801 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnnc2P20801 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnnc2P20801 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnnc2P20801 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnnc2P20801 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnnc2P20801 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnnc2P20801 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnnc2P20801 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnnc2P20801 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnnc2P20801 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnnc2P20801 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnnc2P20801 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnnc2P20801 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnnc2P20801 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnnc2P20801 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnnc2P20801 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnnc2P20801 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnnc2P20801 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnnc2P20801 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnnc2P20801 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnnc2P20801 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnnc2P20801 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnnc2P20801 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnnc2P20801 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnnc2P20801 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnnc2P20801 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnnc2P20801 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnnc2P20801 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnnc2P20801 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnnc2P20801 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnnc2P20801 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnnc2P20801 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnnc2P20801 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnnc2P20801 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnnc2P20801 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnnc2P20801 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnnc2P20801 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnnc2P20801 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnnc2P20801 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnnc2P20801 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnnc2P20801 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnnc2P20801 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnnc2P20801 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnnc2P20801 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnnc2P20801 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnnc2P20801 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnnc2P20801 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnnc2P20801 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnnc2P20801 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnnc2P20801 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnnc2P20801 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnnc2P20801 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnnc2P20801 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnnc2P20801 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnnc2P20801 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnnc2P20801 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnnc2P20801 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnnc2P20801 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnnc2P20801 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnnc2P20801 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnnc2P20801 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnnc2P20801 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnnc2P20801 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnnc2P20801 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnnc2P20801 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnnc2P20801 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnnc2P20801 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnnc2P20801 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnnc2P20801 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnnc2P20801 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tnnc2P20801 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tnnc2P20801 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tnnc2P20801 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tnnc2P20801 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tnnc2P20801 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tnnc2P20801 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tnnc2P20801 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tnnc2P20801 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tnnc2P20801 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tnnc2P20801 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tnnc2P20801 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tnnc2P20801 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tnnc2P20801 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tnnc2P20801 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Tnnc2P20801 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tnnc2P20801 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Tnnc2P20801 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tnnc2P20801 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tnnc2P20801 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tnnc2P20801 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Tnnc2P20801 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tnnc2P20801 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tnnc2P20801 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tnnc2P20801 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tnnc2P20801 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tnnc2P20801 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tnnc2P20801 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tnnc2P20801 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tnnc2P20801 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tnnc2P20801 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms