Protein–RNA interactions for Protein: P20489

Fcer1a, High affinity immunoglobulin epsilon receptor subunit alpha, mousemouse

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Length 250 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fcer1aP20489 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Fcer1aP20489 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Fcer1aP20489 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Fcer1aP20489 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Fcer1aP20489 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Fcer1aP20489 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Fcer1aP20489 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Fcer1aP20489 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Fcer1aP20489 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Fcer1aP20489 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Fcer1aP20489 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Fcer1aP20489 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Fcer1aP20489 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Fcer1aP20489 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Fcer1aP20489 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Fcer1aP20489 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Fcer1aP20489 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Fcer1aP20489 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Fcer1aP20489 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Fcer1aP20489 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Fcer1aP20489 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Fcer1aP20489 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Fcer1aP20489 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Fcer1aP20489 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Fcer1aP20489 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Fcer1aP20489 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Fcer1aP20489 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Fcer1aP20489 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Fcer1aP20489 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Fcer1aP20489 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Fcer1aP20489 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Fcer1aP20489 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Fcer1aP20489 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Fcer1aP20489 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Fcer1aP20489 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Fcer1aP20489 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Fcer1aP20489 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Fcer1aP20489 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Fcer1aP20489 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Fcer1aP20489 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Fcer1aP20489 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Fcer1aP20489 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Fcer1aP20489 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Fcer1aP20489 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Fcer1aP20489 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Fcer1aP20489 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Fcer1aP20489 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Fcer1aP20489 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Fcer1aP20489 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Fcer1aP20489 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Fcer1aP20489 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
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Fcer1aP20489 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Fcer1aP20489 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Fcer1aP20489 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Fcer1aP20489 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Fcer1aP20489 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Fcer1aP20489 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Fcer1aP20489 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
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Fcer1aP20489 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Fcer1aP20489 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Fcer1aP20489 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
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Fcer1aP20489 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Fcer1aP20489 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Fcer1aP20489 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Fcer1aP20489 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Fcer1aP20489 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Fcer1aP20489 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Fcer1aP20489 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Fcer1aP20489 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Fcer1aP20489 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
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Fcer1aP20489 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Fcer1aP20489 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Fcer1aP20489 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Fcer1aP20489 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Fcer1aP20489 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Fcer1aP20489 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Fcer1aP20489 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Fcer1aP20489 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Fcer1aP20489 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Fcer1aP20489 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Fcer1aP20489 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Fcer1aP20489 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Fcer1aP20489 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Fcer1aP20489 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Fcer1aP20489 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Fcer1aP20489 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Fcer1aP20489 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Fcer1aP20489 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Fcer1aP20489 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC12.96□□□□□ -0.34
Fcer1aP20489 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Fcer1aP20489 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
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