Protein–RNA interactions for Protein: P20263

Pou5f1, POU domain, class 5, transcription factor 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 352 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou5f1P20263 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Pou5f1P20263 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pou5f1P20263 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pou5f1P20263 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pou5f1P20263 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pou5f1P20263 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pou5f1P20263 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pou5f1P20263 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pou5f1P20263 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pou5f1P20263 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pou5f1P20263 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pou5f1P20263 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pou5f1P20263 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pou5f1P20263 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pou5f1P20263 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pou5f1P20263 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Pou5f1P20263 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pou5f1P20263 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pou5f1P20263 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pou5f1P20263 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pou5f1P20263 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pou5f1P20263 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pou5f1P20263 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pou5f1P20263 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pou5f1P20263 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pou5f1P20263 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pou5f1P20263 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pou5f1P20263 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pou5f1P20263 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pou5f1P20263 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pou5f1P20263 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pou5f1P20263 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pou5f1P20263 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pou5f1P20263 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pou5f1P20263 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pou5f1P20263 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pou5f1P20263 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pou5f1P20263 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pou5f1P20263 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pou5f1P20263 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pou5f1P20263 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pou5f1P20263 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pou5f1P20263 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pou5f1P20263 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pou5f1P20263 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pou5f1P20263 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pou5f1P20263 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pou5f1P20263 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pou5f1P20263 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pou5f1P20263 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pou5f1P20263 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pou5f1P20263 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pou5f1P20263 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Pou5f1P20263 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pou5f1P20263 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pou5f1P20263 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pou5f1P20263 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pou5f1P20263 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pou5f1P20263 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pou5f1P20263 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pou5f1P20263 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pou5f1P20263 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pou5f1P20263 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pou5f1P20263 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pou5f1P20263 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pou5f1P20263 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pou5f1P20263 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pou5f1P20263 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pou5f1P20263 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pou5f1P20263 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pou5f1P20263 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pou5f1P20263 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pou5f1P20263 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pou5f1P20263 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pou5f1P20263 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pou5f1P20263 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pou5f1P20263 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pou5f1P20263 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pou5f1P20263 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pou5f1P20263 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pou5f1P20263 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pou5f1P20263 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Pou5f1P20263 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pou5f1P20263 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Pou5f1P20263 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pou5f1P20263 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pou5f1P20263 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pou5f1P20263 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Pou5f1P20263 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pou5f1P20263 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pou5f1P20263 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pou5f1P20263 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pou5f1P20263 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pou5f1P20263 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pou5f1P20263 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pou5f1P20263 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pou5f1P20263 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pou5f1P20263 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pou5f1P20263 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pou5f1P20263 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.1 ms