Protein–RNA interactions for Protein: P18911

Rarg, Retinoic acid receptor gamma, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RargP18911 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RargP18911 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RargP18911 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RargP18911 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RargP18911 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
RargP18911 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
RargP18911 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RargP18911 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RargP18911 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
RargP18911 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RargP18911 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RargP18911 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
RargP18911 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RargP18911 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RargP18911 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RargP18911 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RargP18911 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
RargP18911 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RargP18911 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RargP18911 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RargP18911 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RargP18911 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
RargP18911 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RargP18911 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RargP18911 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RargP18911 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
RargP18911 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RargP18911 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RargP18911 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RargP18911 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RargP18911 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
RargP18911 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RargP18911 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RargP18911 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RargP18911 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RargP18911 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RargP18911 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RargP18911 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RargP18911 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RargP18911 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RargP18911 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
RargP18911 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RargP18911 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RargP18911 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RargP18911 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RargP18911 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RargP18911 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RargP18911 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RargP18911 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RargP18911 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RargP18911 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RargP18911 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RargP18911 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RargP18911 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RargP18911 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RargP18911 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RargP18911 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RargP18911 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RargP18911 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RargP18911 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RargP18911 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RargP18911 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RargP18911 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RargP18911 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RargP18911 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RargP18911 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RargP18911 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RargP18911 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RargP18911 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RargP18911 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RargP18911 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RargP18911 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RargP18911 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RargP18911 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RargP18911 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RargP18911 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RargP18911 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RargP18911 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RargP18911 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RargP18911 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RargP18911 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RargP18911 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RargP18911 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RargP18911 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RargP18911 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RargP18911 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RargP18911 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RargP18911 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RargP18911 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RargP18911 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RargP18911 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RargP18911 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RargP18911 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RargP18911 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RargP18911 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RargP18911 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RargP18911 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RargP18911 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RargP18911 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RargP18911 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms