Protein–RNA interactions for Protein: P16460

Ass1, Argininosuccinate synthase, mousemouse

Predictions only

Length 412 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ass1P16460 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ass1P16460 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ass1P16460 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ass1P16460 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ass1P16460 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ass1P16460 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ass1P16460 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ass1P16460 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Ass1P16460 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Ass1P16460 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ass1P16460 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ass1P16460 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ass1P16460 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ass1P16460 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ass1P16460 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ass1P16460 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ass1P16460 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ass1P16460 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ass1P16460 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ass1P16460 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ass1P16460 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ass1P16460 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ass1P16460 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ass1P16460 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Ass1P16460 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ass1P16460 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ass1P16460 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ass1P16460 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ass1P16460 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ass1P16460 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ass1P16460 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ass1P16460 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ass1P16460 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ass1P16460 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ass1P16460 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ass1P16460 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ass1P16460 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ass1P16460 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ass1P16460 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ass1P16460 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ass1P16460 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ass1P16460 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ass1P16460 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Ass1P16460 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ass1P16460 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ass1P16460 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ass1P16460 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ass1P16460 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ass1P16460 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ass1P16460 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ass1P16460 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ass1P16460 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ass1P16460 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ass1P16460 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ass1P16460 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ass1P16460 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ass1P16460 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ass1P16460 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ass1P16460 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ass1P16460 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Ass1P16460 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ass1P16460 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ass1P16460 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ass1P16460 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ass1P16460 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Ass1P16460 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ass1P16460 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ass1P16460 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ass1P16460 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Ass1P16460 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ass1P16460 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ass1P16460 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ass1P16460 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ass1P16460 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ass1P16460 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ass1P16460 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ass1P16460 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ass1P16460 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ass1P16460 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ass1P16460 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ass1P16460 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ass1P16460 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ass1P16460 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ass1P16460 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ass1P16460 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ass1P16460 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ass1P16460 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Ass1P16460 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ass1P16460 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ass1P16460 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ass1P16460 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ass1P16460 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ass1P16460 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ass1P16460 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ass1P16460 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Ass1P16460 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ass1P16460 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ass1P16460 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Ass1P16460 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ass1P16460 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.7 ms