Protein–RNA interactions for Protein: P15409

Rho, Rhodopsin, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RhoP15409 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
RhoP15409 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
RhoP15409 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
RhoP15409 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
RhoP15409 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
RhoP15409 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
RhoP15409 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
RhoP15409 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
RhoP15409 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
RhoP15409 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
RhoP15409 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
RhoP15409 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
RhoP15409 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
RhoP15409 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
RhoP15409 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
RhoP15409 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
RhoP15409 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
RhoP15409 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
RhoP15409 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
RhoP15409 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
RhoP15409 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
RhoP15409 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
RhoP15409 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
RhoP15409 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
RhoP15409 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
RhoP15409 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
RhoP15409 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
RhoP15409 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
RhoP15409 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
RhoP15409 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
RhoP15409 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
RhoP15409 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
RhoP15409 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
RhoP15409 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
RhoP15409 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
RhoP15409 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
RhoP15409 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
RhoP15409 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
RhoP15409 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
RhoP15409 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
RhoP15409 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
RhoP15409 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
RhoP15409 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
RhoP15409 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
RhoP15409 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
RhoP15409 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
RhoP15409 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
RhoP15409 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
RhoP15409 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
RhoP15409 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
RhoP15409 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
RhoP15409 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
RhoP15409 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
RhoP15409 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
RhoP15409 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
RhoP15409 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
RhoP15409 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
RhoP15409 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
RhoP15409 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
RhoP15409 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
RhoP15409 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
RhoP15409 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
RhoP15409 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
RhoP15409 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
RhoP15409 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
RhoP15409 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
RhoP15409 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
RhoP15409 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
RhoP15409 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
RhoP15409 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
RhoP15409 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
RhoP15409 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
RhoP15409 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
RhoP15409 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
RhoP15409 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
RhoP15409 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RhoP15409 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
RhoP15409 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RhoP15409 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RhoP15409 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RhoP15409 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RhoP15409 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
RhoP15409 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RhoP15409 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RhoP15409 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
RhoP15409 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RhoP15409 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RhoP15409 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
RhoP15409 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
RhoP15409 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
RhoP15409 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
RhoP15409 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
RhoP15409 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
RhoP15409 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
RhoP15409 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
RhoP15409 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
RhoP15409 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
RhoP15409 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RhoP15409 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RhoP15409 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.2 ms