Protein–RNA interactions for Protein: P15331

Prph, Peripherin, mousemouse

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Length 475 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrphP15331 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PrphP15331 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PrphP15331 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PrphP15331 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PrphP15331 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PrphP15331 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PrphP15331 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PrphP15331 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PrphP15331 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
PrphP15331 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PrphP15331 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PrphP15331 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PrphP15331 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PrphP15331 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PrphP15331 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PrphP15331 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PrphP15331 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PrphP15331 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PrphP15331 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PrphP15331 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PrphP15331 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PrphP15331 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PrphP15331 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PrphP15331 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PrphP15331 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PrphP15331 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PrphP15331 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PrphP15331 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PrphP15331 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PrphP15331 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PrphP15331 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
PrphP15331 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PrphP15331 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PrphP15331 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PrphP15331 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
PrphP15331 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
PrphP15331 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PrphP15331 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
PrphP15331 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
PrphP15331 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PrphP15331 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PrphP15331 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
PrphP15331 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
PrphP15331 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PrphP15331 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PrphP15331 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PrphP15331 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
PrphP15331 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PrphP15331 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PrphP15331 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PrphP15331 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PrphP15331 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PrphP15331 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PrphP15331 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PrphP15331 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PrphP15331 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PrphP15331 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PrphP15331 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PrphP15331 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PrphP15331 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PrphP15331 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PrphP15331 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PrphP15331 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PrphP15331 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PrphP15331 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PrphP15331 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PrphP15331 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PrphP15331 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PrphP15331 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PrphP15331 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PrphP15331 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PrphP15331 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PrphP15331 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PrphP15331 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PrphP15331 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PrphP15331 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PrphP15331 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PrphP15331 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PrphP15331 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PrphP15331 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PrphP15331 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PrphP15331 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PrphP15331 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PrphP15331 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PrphP15331 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PrphP15331 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PrphP15331 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PrphP15331 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PrphP15331 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PrphP15331 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PrphP15331 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PrphP15331 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PrphP15331 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PrphP15331 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PrphP15331 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PrphP15331 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PrphP15331 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PrphP15331 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PrphP15331 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PrphP15331 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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