Protein–RNA interactions for Protein: P11531

Dmd, Dystrophin, mousemouse

Predictions only

Length 3,678 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DmdP11531 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
DmdP11531 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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DmdP11531 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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DmdP11531 Gm6981-201ENSMUST00000182467 1008 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
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DmdP11531 Nr0b2-201ENSMUST00000042706 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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DmdP11531 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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DmdP11531 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
DmdP11531 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
DmdP11531 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
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DmdP11531 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
DmdP11531 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
DmdP11531 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
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DmdP11531 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
DmdP11531 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
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DmdP11531 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
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DmdP11531 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
DmdP11531 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
DmdP11531 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
DmdP11531 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
DmdP11531 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
DmdP11531 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
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DmdP11531 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
DmdP11531 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
DmdP11531 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
DmdP11531 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
DmdP11531 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
DmdP11531 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
DmdP11531 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
DmdP11531 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
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