Protein–RNA interactions for Protein: P11369

Pol, LINE-1 retrotransposable element ORF2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PolP11369 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
PolP11369 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PolP11369 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PolP11369 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
PolP11369 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
PolP11369 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PolP11369 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PolP11369 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PolP11369 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PolP11369 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PolP11369 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PolP11369 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PolP11369 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PolP11369 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PolP11369 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PolP11369 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PolP11369 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PolP11369 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PolP11369 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PolP11369 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PolP11369 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PolP11369 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PolP11369 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PolP11369 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PolP11369 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PolP11369 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PolP11369 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PolP11369 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
PolP11369 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PolP11369 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PolP11369 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
PolP11369 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PolP11369 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PolP11369 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PolP11369 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PolP11369 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PolP11369 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PolP11369 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PolP11369 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PolP11369 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PolP11369 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PolP11369 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PolP11369 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PolP11369 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PolP11369 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PolP11369 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PolP11369 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PolP11369 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PolP11369 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PolP11369 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PolP11369 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PolP11369 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PolP11369 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PolP11369 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PolP11369 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PolP11369 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PolP11369 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PolP11369 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
PolP11369 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PolP11369 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PolP11369 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PolP11369 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
PolP11369 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PolP11369 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
PolP11369 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
PolP11369 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
PolP11369 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
PolP11369 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PolP11369 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
PolP11369 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PolP11369 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PolP11369 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PolP11369 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PolP11369 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
PolP11369 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PolP11369 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PolP11369 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
PolP11369 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PolP11369 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PolP11369 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PolP11369 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PolP11369 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PolP11369 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PolP11369 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PolP11369 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PolP11369 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PolP11369 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PolP11369 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PolP11369 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
PolP11369 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PolP11369 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
PolP11369 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
PolP11369 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
PolP11369 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PolP11369 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
PolP11369 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PolP11369 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PolP11369 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
PolP11369 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PolP11369 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 122 ms