Protein–RNA interactions for Protein: P09055

Itgb1, Integrin beta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb1P09055 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Itgb1P09055 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Itgb1P09055 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Itgb1P09055 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Itgb1P09055 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Itgb1P09055 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Itgb1P09055 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Itgb1P09055 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Itgb1P09055 Mir1938-201ENSMUST00000158746 100 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Itgb1P09055 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Itgb1P09055 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Itgb1P09055 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Itgb1P09055 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Itgb1P09055 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Itgb1P09055 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Itgb1P09055 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Itgb1P09055 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Itgb1P09055 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Itgb1P09055 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Itgb1P09055 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Itgb1P09055 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Itgb1P09055 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Itgb1P09055 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Itgb1P09055 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Itgb1P09055 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Itgb1P09055 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Itgb1P09055 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Itgb1P09055 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Itgb1P09055 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Itgb1P09055 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Itgb1P09055 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Itgb1P09055 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Itgb1P09055 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Itgb1P09055 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Itgb1P09055 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Itgb1P09055 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Itgb1P09055 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Itgb1P09055 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Itgb1P09055 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Itgb1P09055 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Itgb1P09055 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Itgb1P09055 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Itgb1P09055 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Itgb1P09055 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Itgb1P09055 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Itgb1P09055 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Itgb1P09055 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Itgb1P09055 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Itgb1P09055 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Itgb1P09055 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Itgb1P09055 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Itgb1P09055 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Itgb1P09055 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Itgb1P09055 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Itgb1P09055 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Itgb1P09055 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Itgb1P09055 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Itgb1P09055 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Itgb1P09055 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Itgb1P09055 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Itgb1P09055 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Itgb1P09055 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Itgb1P09055 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Itgb1P09055 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Itgb1P09055 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Itgb1P09055 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Itgb1P09055 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Itgb1P09055 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Itgb1P09055 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Itgb1P09055 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Itgb1P09055 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Itgb1P09055 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Itgb1P09055 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Itgb1P09055 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Itgb1P09055 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Itgb1P09055 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Itgb1P09055 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Itgb1P09055 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Itgb1P09055 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Itgb1P09055 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Itgb1P09055 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Itgb1P09055 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Itgb1P09055 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Itgb1P09055 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Itgb1P09055 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Itgb1P09055 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Itgb1P09055 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Itgb1P09055 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Itgb1P09055 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Itgb1P09055 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Itgb1P09055 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Itgb1P09055 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Itgb1P09055 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Itgb1P09055 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.06■□□□□ 0
Itgb1P09055 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Itgb1P09055 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Itgb1P09055 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Itgb1P09055 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Itgb1P09055 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC15.05■□□□□ 0
Itgb1P09055 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms