Protein–RNA interactions for Protein: P09021

Hoxa5, Homeobox protein Hox-A5, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa5P09021 Apol7e-201ENSMUST00000096358 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Hoxa5P09021 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Hoxa5P09021 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Hoxa5P09021 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Hoxa5P09021 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Hoxa5P09021 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Hoxa5P09021 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Hoxa5P09021 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Hoxa5P09021 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Hoxa5P09021 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Hoxa5P09021 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Hoxa5P09021 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Hoxa5P09021 Fam198a-203ENSMUST00000214536 2789 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Hoxa5P09021 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Hoxa5P09021 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Hoxa5P09021 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Hoxa5P09021 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Hoxa5P09021 Gypa-201ENSMUST00000063359 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Hoxa5P09021 A530016L24Rik-201ENSMUST00000057465 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Hoxa5P09021 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Hoxa5P09021 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Hoxa5P09021 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Hoxa5P09021 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Hoxa5P09021 Ccpg1-208ENSMUST00000150826 2939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Hoxa5P09021 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Hoxa5P09021 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Hoxa5P09021 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Hoxa5P09021 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Hoxa5P09021 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Hoxa5P09021 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Hoxa5P09021 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Hoxa5P09021 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Hoxa5P09021 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Hoxa5P09021 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Hoxa5P09021 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Hoxa5P09021 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Hoxa5P09021 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Hoxa5P09021 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Hoxa5P09021 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Hoxa5P09021 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Hoxa5P09021 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Hoxa5P09021 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Hoxa5P09021 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Hoxa5P09021 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Hoxa5P09021 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Hoxa5P09021 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Hoxa5P09021 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Hoxa5P09021 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Hoxa5P09021 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Hoxa5P09021 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Hoxa5P09021 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Hoxa5P09021 Cyth1-203ENSMUST00000106302 3119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Hoxa5P09021 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Hoxa5P09021 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Hoxa5P09021 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Hoxa5P09021 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Hoxa5P09021 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Hoxa5P09021 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Hoxa5P09021 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Hoxa5P09021 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Hoxa5P09021 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Hoxa5P09021 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Hoxa5P09021 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Hoxa5P09021 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Hoxa5P09021 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Hoxa5P09021 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Hoxa5P09021 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Hoxa5P09021 Gm16582-201ENSMUST00000159627 1930 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Hoxa5P09021 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Hoxa5P09021 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Hoxa5P09021 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Hoxa5P09021 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Hoxa5P09021 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Hoxa5P09021 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Hoxa5P09021 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Hoxa5P09021 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Hoxa5P09021 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Hoxa5P09021 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Hoxa5P09021 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Hoxa5P09021 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Hoxa5P09021 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Hoxa5P09021 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Hoxa5P09021 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Hoxa5P09021 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Hoxa5P09021 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Hoxa5P09021 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Hoxa5P09021 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Hoxa5P09021 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Hoxa5P09021 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Hoxa5P09021 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Hoxa5P09021 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Hoxa5P09021 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Hoxa5P09021 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Hoxa5P09021 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Hoxa5P09021 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Hoxa5P09021 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Hoxa5P09021 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Hoxa5P09021 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Hoxa5P09021 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Hoxa5P09021 2610001J05Rik-203ENSMUST00000185219 1606 ntAPPRIS P1 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.3 ms