Protein–RNA interactions for Protein: P04214

T-cell receptor beta chain V region E1, mousemouse

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Length 136 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P04214 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
P04214 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
P04214 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
P04214 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC14.97□□□□□ -0.01
P04214 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
P04214 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
P04214 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
P04214 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
P04214 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
P04214 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
P04214 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
P04214 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
P04214 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
P04214 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
P04214 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
P04214 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
P04214 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
P04214 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
P04214 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
P04214 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
P04214 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
P04214 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
P04214 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
P04214 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
P04214 Agtpbp1-213ENSMUST00000167096 508 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
P04214 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
P04214 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
P04214 Gm8565-201ENSMUST00000183259 1014 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
P04214 Gm27572-201ENSMUST00000183702 255 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
P04214 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
P04214 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
P04214 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
P04214 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
P04214 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
P04214 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
P04214 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
P04214 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
P04214 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
P04214 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
P04214 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
P04214 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
P04214 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
P04214 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
P04214 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
P04214 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
P04214 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC14.96□□□□□ -0.02
P04214 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
P04214 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
P04214 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
P04214 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
P04214 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
P04214 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
P04214 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
P04214 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
P04214 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
P04214 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
P04214 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
P04214 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
P04214 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
P04214 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
P04214 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
P04214 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
P04214 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
P04214 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
P04214 Gm5187-201ENSMUST00000117317 991 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
P04214 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
P04214 Nudt17-202ENSMUST00000171249 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
P04214 Gm26542-201ENSMUST00000180443 1235 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
P04214 Sox2ot-208ENSMUST00000197103 802 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
P04214 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
P04214 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
P04214 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
P04214 Olfr707-201ENSMUST00000088687 924 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
P04214 Olfr1532-ps1-201ENSMUST00000098140 924 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
P04214 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
P04214 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
P04214 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
P04214 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
P04214 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
P04214 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
P04214 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
P04214 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
P04214 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
P04214 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
P04214 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
P04214 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
P04214 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
P04214 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
P04214 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
P04214 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
P04214 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
P04214 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
P04214 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
P04214 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
P04214 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
P04214 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
P04214 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
P04214 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
P04214 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
P04214 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms