Protein–RNA interactions for Protein: P02340

Tp53, Cellular tumor antigen p53, mousemouse

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tp53P02340 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tp53P02340 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tp53P02340 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tp53P02340 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tp53P02340 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Tp53P02340 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tp53P02340 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tp53P02340 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tp53P02340 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tp53P02340 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tp53P02340 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tp53P02340 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tp53P02340 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tp53P02340 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tp53P02340 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tp53P02340 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tp53P02340 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tp53P02340 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tp53P02340 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tp53P02340 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tp53P02340 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tp53P02340 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tp53P02340 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tp53P02340 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tp53P02340 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tp53P02340 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tp53P02340 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tp53P02340 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tp53P02340 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tp53P02340 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tp53P02340 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tp53P02340 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tp53P02340 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tp53P02340 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tp53P02340 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tp53P02340 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tp53P02340 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tp53P02340 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tp53P02340 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tp53P02340 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tp53P02340 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tp53P02340 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Tp53P02340 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Tp53P02340 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Tp53P02340 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Tp53P02340 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Tp53P02340 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Tp53P02340 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Tp53P02340 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tp53P02340 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tp53P02340 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tp53P02340 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tp53P02340 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Tp53P02340 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tp53P02340 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tp53P02340 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tp53P02340 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tp53P02340 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tp53P02340 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tp53P02340 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tp53P02340 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tp53P02340 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Tp53P02340 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tp53P02340 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tp53P02340 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tp53P02340 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tp53P02340 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tp53P02340 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tp53P02340 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tp53P02340 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tp53P02340 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tp53P02340 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tp53P02340 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tp53P02340 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tp53P02340 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tp53P02340 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tp53P02340 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tp53P02340 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tp53P02340 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tp53P02340 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tp53P02340 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tp53P02340 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tp53P02340 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tp53P02340 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tp53P02340 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tp53P02340 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tp53P02340 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tp53P02340 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tp53P02340 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tp53P02340 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tp53P02340 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tp53P02340 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tp53P02340 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tp53P02340 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tp53P02340 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tp53P02340 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tp53P02340 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Tp53P02340 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tp53P02340 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tp53P02340 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.8 ms