Protein–RNA interactions for Protein: P01853

T-cell receptor gamma chain C region C10.5, mousemouse

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Length 167 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01853 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
P01853 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
P01853 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
P01853 Sertad2-203ENSMUST00000109586 5515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
P01853 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
P01853 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
P01853 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
P01853 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
P01853 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
P01853 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
P01853 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
P01853 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
P01853 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
P01853 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
P01853 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
P01853 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
P01853 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
P01853 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
P01853 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
P01853 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
P01853 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
P01853 Iqsec3-203ENSMUST00000151397 8067 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
P01853 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
P01853 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
P01853 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
P01853 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
P01853 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
P01853 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
P01853 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
P01853 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
P01853 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
P01853 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
P01853 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
P01853 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
P01853 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
P01853 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
P01853 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
P01853 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
P01853 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
P01853 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
P01853 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
P01853 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
P01853 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
P01853 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
P01853 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
P01853 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
P01853 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
P01853 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
P01853 Bach2-202ENSMUST00000108180 8882 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
P01853 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
P01853 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
P01853 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
P01853 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
P01853 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
P01853 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
P01853 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
P01853 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
P01853 Cep164-201ENSMUST00000117194 5541 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
P01853 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
P01853 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
P01853 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
P01853 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
P01853 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
P01853 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
P01853 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
P01853 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
P01853 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
P01853 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
P01853 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
P01853 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
P01853 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
P01853 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
P01853 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
P01853 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
P01853 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
P01853 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
P01853 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
P01853 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
P01853 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
P01853 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
P01853 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
P01853 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
P01853 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
P01853 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
P01853 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
P01853 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
P01853 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
P01853 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
P01853 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
P01853 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
P01853 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
P01853 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
P01853 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
P01853 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
P01853 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
P01853 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
P01853 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
P01853 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
P01853 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
P01853 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
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