Protein–RNA interactions for Protein: O54942

Cldn5, Claudin-5, mousemouse

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Length 218 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn5O54942 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cldn5O54942 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cldn5O54942 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cldn5O54942 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cldn5O54942 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cldn5O54942 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cldn5O54942 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cldn5O54942 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cldn5O54942 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cldn5O54942 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cldn5O54942 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cldn5O54942 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
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Cldn5O54942 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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Cldn5O54942 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Cldn5O54942 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cldn5O54942 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
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Cldn5O54942 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cldn5O54942 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
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Cldn5O54942 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Cldn5O54942 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Cldn5O54942 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Cldn5O54942 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cldn5O54942 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cldn5O54942 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cldn5O54942 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cldn5O54942 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Cldn5O54942 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cldn5O54942 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cldn5O54942 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cldn5O54942 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Cldn5O54942 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cldn5O54942 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Cldn5O54942 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cldn5O54942 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Cldn5O54942 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cldn5O54942 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cldn5O54942 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Cldn5O54942 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Cldn5O54942 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cldn5O54942 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Cldn5O54942 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cldn5O54942 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Cldn5O54942 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cldn5O54942 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Cldn5O54942 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Cldn5O54942 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cldn5O54942 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cldn5O54942 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cldn5O54942 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
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Cldn5O54942 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cldn5O54942 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cldn5O54942 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cldn5O54942 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cldn5O54942 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cldn5O54942 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cldn5O54942 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cldn5O54942 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cldn5O54942 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cldn5O54942 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cldn5O54942 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cldn5O54942 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cldn5O54942 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cldn5O54942 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cldn5O54942 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cldn5O54942 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cldn5O54942 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cldn5O54942 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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