Protein–RNA interactions for Protein: O35988

Sdc4, Syndecan-4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 198 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sdc4O35988 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sdc4O35988 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sdc4O35988 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sdc4O35988 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sdc4O35988 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sdc4O35988 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sdc4O35988 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sdc4O35988 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sdc4O35988 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sdc4O35988 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sdc4O35988 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Sdc4O35988 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sdc4O35988 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sdc4O35988 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sdc4O35988 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sdc4O35988 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sdc4O35988 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Sdc4O35988 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sdc4O35988 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sdc4O35988 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sdc4O35988 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sdc4O35988 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sdc4O35988 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sdc4O35988 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sdc4O35988 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Sdc4O35988 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Sdc4O35988 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Sdc4O35988 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sdc4O35988 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sdc4O35988 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sdc4O35988 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sdc4O35988 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sdc4O35988 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sdc4O35988 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sdc4O35988 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sdc4O35988 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sdc4O35988 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sdc4O35988 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sdc4O35988 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sdc4O35988 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sdc4O35988 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sdc4O35988 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sdc4O35988 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sdc4O35988 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sdc4O35988 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sdc4O35988 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Sdc4O35988 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sdc4O35988 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Sdc4O35988 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sdc4O35988 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sdc4O35988 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Sdc4O35988 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Sdc4O35988 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sdc4O35988 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sdc4O35988 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Sdc4O35988 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sdc4O35988 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sdc4O35988 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sdc4O35988 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sdc4O35988 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sdc4O35988 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Sdc4O35988 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Sdc4O35988 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sdc4O35988 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sdc4O35988 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sdc4O35988 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sdc4O35988 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sdc4O35988 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sdc4O35988 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Sdc4O35988 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Sdc4O35988 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Sdc4O35988 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Sdc4O35988 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Sdc4O35988 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Sdc4O35988 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Sdc4O35988 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Sdc4O35988 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Sdc4O35988 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Sdc4O35988 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Sdc4O35988 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Sdc4O35988 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Sdc4O35988 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Sdc4O35988 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Sdc4O35988 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Sdc4O35988 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Sdc4O35988 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Sdc4O35988 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Sdc4O35988 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Sdc4O35988 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Sdc4O35988 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Sdc4O35988 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Sdc4O35988 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Sdc4O35988 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Sdc4O35988 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Sdc4O35988 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Sdc4O35988 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Sdc4O35988 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Sdc4O35988 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sdc4O35988 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sdc4O35988 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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