Protein–RNA interactions for Protein: O35904

Pik3cd, Phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit delta isoform, mousemouse

Predictions only

Length 1,043 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pik3cdO35904 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pik3cdO35904 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pik3cdO35904 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pik3cdO35904 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pik3cdO35904 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pik3cdO35904 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pik3cdO35904 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pik3cdO35904 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pik3cdO35904 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pik3cdO35904 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pik3cdO35904 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pik3cdO35904 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pik3cdO35904 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pik3cdO35904 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pik3cdO35904 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pik3cdO35904 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pik3cdO35904 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pik3cdO35904 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pik3cdO35904 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pik3cdO35904 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pik3cdO35904 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pik3cdO35904 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pik3cdO35904 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pik3cdO35904 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pik3cdO35904 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pik3cdO35904 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Pik3cdO35904 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pik3cdO35904 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pik3cdO35904 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pik3cdO35904 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pik3cdO35904 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pik3cdO35904 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pik3cdO35904 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pik3cdO35904 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pik3cdO35904 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pik3cdO35904 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pik3cdO35904 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pik3cdO35904 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pik3cdO35904 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pik3cdO35904 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pik3cdO35904 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pik3cdO35904 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pik3cdO35904 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pik3cdO35904 Gm29310-201ENSMUST00000185468 696 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Pik3cdO35904 Gm21825-201ENSMUST00000185728 696 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Pik3cdO35904 Gm29109-201ENSMUST00000185895 696 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Pik3cdO35904 Gm21896-201ENSMUST00000186520 696 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Pik3cdO35904 Gm21873-201ENSMUST00000186728 696 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Pik3cdO35904 Gm21794-201ENSMUST00000187056 696 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Pik3cdO35904 Gm21880-201ENSMUST00000187275 696 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Pik3cdO35904 Gm21826-201ENSMUST00000187451 696 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Pik3cdO35904 Gm21198-201ENSMUST00000188393 696 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Pik3cdO35904 Gm21749-201ENSMUST00000189343 696 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Pik3cdO35904 Gm21901-201ENSMUST00000189568 696 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Pik3cdO35904 Gm29424-201ENSMUST00000189716 696 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Pik3cdO35904 Gm28599-201ENSMUST00000189838 694 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Pik3cdO35904 Gm21867-201ENSMUST00000189917 696 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Pik3cdO35904 Gm29269-201ENSMUST00000190087 696 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Pik3cdO35904 Gm21722-201ENSMUST00000190153 696 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Pik3cdO35904 Gm28423-201ENSMUST00000190701 696 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Pik3cdO35904 Gm21899-201ENSMUST00000190745 696 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Pik3cdO35904 Gm21910-201ENSMUST00000191163 696 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Pik3cdO35904 Gm21849-201ENSMUST00000191571 696 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Pik3cdO35904 Gm28678-201ENSMUST00000191593 696 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Pik3cdO35904 Gm20910-201ENSMUST00000193268 696 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Pik3cdO35904 Gm21871-201ENSMUST00000194621 696 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Pik3cdO35904 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pik3cdO35904 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pik3cdO35904 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pik3cdO35904 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pik3cdO35904 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pik3cdO35904 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pik3cdO35904 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pik3cdO35904 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pik3cdO35904 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pik3cdO35904 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pik3cdO35904 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pik3cdO35904 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pik3cdO35904 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pik3cdO35904 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pik3cdO35904 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pik3cdO35904 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pik3cdO35904 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pik3cdO35904 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pik3cdO35904 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pik3cdO35904 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pik3cdO35904 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pik3cdO35904 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pik3cdO35904 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pik3cdO35904 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pik3cdO35904 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Pik3cdO35904 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pik3cdO35904 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Pik3cdO35904 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pik3cdO35904 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pik3cdO35904 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pik3cdO35904 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pik3cdO35904 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Pik3cdO35904 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pik3cdO35904 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms