Protein–RNA interactions for Protein: O35690

Phox2b, Paired mesoderm homeobox protein 2B, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phox2bO35690 Rpl28-ps3-201ENSMUST00000116058 393 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Phox2bO35690 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Phox2bO35690 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Phox2bO35690 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Phox2bO35690 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Phox2bO35690 Swi5-207ENSMUST00000183946 768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Phox2bO35690 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Phox2bO35690 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Phox2bO35690 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Phox2bO35690 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Phox2bO35690 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Phox2bO35690 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Phox2bO35690 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Phox2bO35690 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Phox2bO35690 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Phox2bO35690 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Phox2bO35690 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Phox2bO35690 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Phox2bO35690 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Phox2bO35690 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Phox2bO35690 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Phox2bO35690 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Phox2bO35690 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Phox2bO35690 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Phox2bO35690 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Phox2bO35690 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Phox2bO35690 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Phox2bO35690 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Phox2bO35690 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Phox2bO35690 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Phox2bO35690 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Phox2bO35690 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Phox2bO35690 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Phox2bO35690 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Phox2bO35690 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Phox2bO35690 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Phox2bO35690 Gm12176-201ENSMUST00000121420 875 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Phox2bO35690 Nr6a1os-201ENSMUST00000129089 645 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Phox2bO35690 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Phox2bO35690 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Phox2bO35690 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Phox2bO35690 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Phox2bO35690 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Phox2bO35690 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Phox2bO35690 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Phox2bO35690 Gm39318-201ENSMUST00000214606 1118 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Phox2bO35690 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Phox2bO35690 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Phox2bO35690 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Phox2bO35690 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Phox2bO35690 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Phox2bO35690 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Phox2bO35690 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Phox2bO35690 Rpl10-201ENSMUST00000008826 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Phox2bO35690 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Phox2bO35690 Olfr1209-201ENSMUST00000099809 933 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Phox2bO35690 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Phox2bO35690 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Phox2bO35690 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Phox2bO35690 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Phox2bO35690 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Phox2bO35690 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Phox2bO35690 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Phox2bO35690 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Phox2bO35690 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Phox2bO35690 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Phox2bO35690 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Phox2bO35690 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Phox2bO35690 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Phox2bO35690 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Phox2bO35690 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Phox2bO35690 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Phox2bO35690 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Phox2bO35690 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Phox2bO35690 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Phox2bO35690 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Phox2bO35690 Gm13183-201ENSMUST00000118615 789 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Phox2bO35690 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Phox2bO35690 Gm16570-201ENSMUST00000161951 436 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Phox2bO35690 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Phox2bO35690 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Phox2bO35690 Gm37720-201ENSMUST00000195497 1241 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Phox2bO35690 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Phox2bO35690 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Phox2bO35690 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Phox2bO35690 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Phox2bO35690 Mettl5-201ENSMUST00000060447 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Phox2bO35690 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Phox2bO35690 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Phox2bO35690 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Phox2bO35690 Gm18222-201ENSMUST00000202416 1387 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Phox2bO35690 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Phox2bO35690 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Phox2bO35690 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Phox2bO35690 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Phox2bO35690 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Phox2bO35690 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Phox2bO35690 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Phox2bO35690 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Phox2bO35690 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.7 ms