Protein–RNA interactions for Protein: O35452

Tnxb, Tenascin X, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TnxbO35452 Gm18615-201ENSMUST00000222919 1031 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
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TnxbO35452 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
TnxbO35452 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
TnxbO35452 Mapkapk5-204ENSMUST00000111783 1513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
TnxbO35452 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
TnxbO35452 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
TnxbO35452 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
TnxbO35452 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
TnxbO35452 Ccna1-204ENSMUST00000198320 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
TnxbO35452 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
TnxbO35452 Fgf8-203ENSMUST00000111924 630 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
TnxbO35452 Churc1-203ENSMUST00000126408 462 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
TnxbO35452 Pgam2-201ENSMUST00000020768 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
TnxbO35452 4930442H23Rik-201ENSMUST00000056086 1245 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
TnxbO35452 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
TnxbO35452 Nab1-204ENSMUST00000170269 1371 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
TnxbO35452 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.79
TnxbO35452 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
TnxbO35452 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
TnxbO35452 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.79
TnxbO35452 Hax1-206ENSMUST00000197786 857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
TnxbO35452 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
TnxbO35452 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
TnxbO35452 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
TnxbO35452 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
TnxbO35452 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
TnxbO35452 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
TnxbO35452 Olfr1349-204ENSMUST00000207820 1325 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
TnxbO35452 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
TnxbO35452 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
TnxbO35452 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
TnxbO35452 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
TnxbO35452 Mettl1-202ENSMUST00000120542 1044 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
TnxbO35452 4930502E09Rik-201ENSMUST00000126016 755 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
TnxbO35452 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
TnxbO35452 Hsd17b10-201ENSMUST00000026289 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
TnxbO35452 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
TnxbO35452 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
TnxbO35452 Fcna-201ENSMUST00000028307 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
TnxbO35452 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
TnxbO35452 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
TnxbO35452 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
TnxbO35452 Gm43579-201ENSMUST00000202387 1307 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
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TnxbO35452 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
TnxbO35452 Gm13609-201ENSMUST00000141023 589 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
TnxbO35452 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
TnxbO35452 Gm3890-201ENSMUST00000182416 207 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
TnxbO35452 Gm8365-201ENSMUST00000197334 648 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
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TnxbO35452 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
TnxbO35452 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
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TnxbO35452 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
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TnxbO35452 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
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TnxbO35452 Gm13611-201ENSMUST00000118269 318 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
TnxbO35452 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
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TnxbO35452 Mir99ahg-209ENSMUST00000182820 835 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
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TnxbO35452 Rbp2-201ENSMUST00000035029 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
TnxbO35452 Spink2-201ENSMUST00000065216 631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
TnxbO35452 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
TnxbO35452 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
TnxbO35452 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
TnxbO35452 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
TnxbO35452 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
TnxbO35452 Atp5d-202ENSMUST00000105366 781 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
TnxbO35452 Mc5r-201ENSMUST00000172148 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
TnxbO35452 AA914427-201ENSMUST00000193194 1166 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
TnxbO35452 Nps-202ENSMUST00000210697 1082 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
TnxbO35452 Rps2-ps12-201ENSMUST00000214262 785 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
TnxbO35452 Gm6867-201ENSMUST00000219165 425 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
TnxbO35452 Lrrc52-201ENSMUST00000036643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
TnxbO35452 Krtap19-1-201ENSMUST00000081334 493 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
TnxbO35452 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
TnxbO35452 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
TnxbO35452 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
TnxbO35452 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
TnxbO35452 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
TnxbO35452 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
TnxbO35452 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
TnxbO35452 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
TnxbO35452 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
TnxbO35452 Gm38979-201ENSMUST00000207099 698 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
TnxbO35452 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
TnxbO35452 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
TnxbO35452 Gm9996-201ENSMUST00000070359 913 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
TnxbO35452 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
TnxbO35452 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
TnxbO35452 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
TnxbO35452 Taz-204ENSMUST00000124200 1742 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
TnxbO35452 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
TnxbO35452 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
TnxbO35452 Irx3os-203ENSMUST00000133528 1354 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.5 ms