Protein–RNA interactions for Protein: O09044

Snap23, Synaptosomal-associated protein 23, mousemouse

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snap23O09044 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Snap23O09044 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Snap23O09044 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Snap23O09044 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Snap23O09044 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Snap23O09044 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Snap23O09044 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Snap23O09044 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Snap23O09044 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Snap23O09044 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Snap23O09044 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Snap23O09044 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Snap23O09044 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Snap23O09044 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Snap23O09044 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Snap23O09044 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Snap23O09044 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Snap23O09044 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Snap23O09044 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Snap23O09044 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Snap23O09044 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Snap23O09044 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Snap23O09044 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Snap23O09044 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Snap23O09044 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Snap23O09044 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Snap23O09044 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Snap23O09044 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Snap23O09044 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Snap23O09044 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Snap23O09044 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Snap23O09044 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Snap23O09044 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Snap23O09044 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Snap23O09044 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Snap23O09044 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Snap23O09044 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Snap23O09044 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Snap23O09044 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Snap23O09044 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Snap23O09044 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Snap23O09044 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Snap23O09044 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Snap23O09044 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Snap23O09044 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Snap23O09044 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Snap23O09044 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Snap23O09044 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Snap23O09044 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Snap23O09044 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Snap23O09044 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Snap23O09044 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Snap23O09044 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Snap23O09044 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Snap23O09044 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Snap23O09044 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Snap23O09044 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Snap23O09044 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Snap23O09044 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Snap23O09044 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Snap23O09044 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Snap23O09044 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Snap23O09044 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Snap23O09044 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Snap23O09044 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Snap23O09044 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Snap23O09044 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Snap23O09044 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Snap23O09044 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Snap23O09044 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Snap23O09044 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Snap23O09044 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Snap23O09044 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Snap23O09044 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Snap23O09044 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Snap23O09044 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Snap23O09044 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Snap23O09044 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Snap23O09044 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Snap23O09044 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Snap23O09044 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Snap23O09044 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Snap23O09044 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Snap23O09044 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Snap23O09044 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Snap23O09044 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Snap23O09044 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Snap23O09044 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Snap23O09044 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Snap23O09044 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Snap23O09044 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Snap23O09044 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Snap23O09044 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Snap23O09044 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Snap23O09044 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Snap23O09044 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Snap23O09044 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Snap23O09044 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Snap23O09044 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Snap23O09044 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.6 ms