Protein–RNA interactions for Protein: O09005

Degs1, Sphingolipid delta(4)-desaturase DES1, mousemouse

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Length 323 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Degs1O09005 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Degs1O09005 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Degs1O09005 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Degs1O09005 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Degs1O09005 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Degs1O09005 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Degs1O09005 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Degs1O09005 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Degs1O09005 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Degs1O09005 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Degs1O09005 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Degs1O09005 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Degs1O09005 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Degs1O09005 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Degs1O09005 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Degs1O09005 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Degs1O09005 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Degs1O09005 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Degs1O09005 Camk4-201ENSMUST00000042868 12331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Degs1O09005 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Degs1O09005 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Degs1O09005 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Degs1O09005 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
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Degs1O09005 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Degs1O09005 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Degs1O09005 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Degs1O09005 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Degs1O09005 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Degs1O09005 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Degs1O09005 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Degs1O09005 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
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Degs1O09005 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
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Degs1O09005 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
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Degs1O09005 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Degs1O09005 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Degs1O09005 Pgr-204ENSMUST00000189181 6889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Degs1O09005 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Degs1O09005 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
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Degs1O09005 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
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Degs1O09005 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Degs1O09005 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
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Degs1O09005 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Degs1O09005 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Degs1O09005 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Degs1O09005 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
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Degs1O09005 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Degs1O09005 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Degs1O09005 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Degs1O09005 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Degs1O09005 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Degs1O09005 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Degs1O09005 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Degs1O09005 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Degs1O09005 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Degs1O09005 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Degs1O09005 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Degs1O09005 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Degs1O09005 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Degs1O09005 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Degs1O09005 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Degs1O09005 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Degs1O09005 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Degs1O09005 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Degs1O09005 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Degs1O09005 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Degs1O09005 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Degs1O09005 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Degs1O09005 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Degs1O09005 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Degs1O09005 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Degs1O09005 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Degs1O09005 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Degs1O09005 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Degs1O09005 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Degs1O09005 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Degs1O09005 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms