Protein–RNA interactions for Protein: O08686

Barx2, Homeobox protein BarH-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Barx2O08686 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Barx2O08686 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Barx2O08686 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Barx2O08686 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Barx2O08686 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Barx2O08686 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Barx2O08686 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Barx2O08686 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Barx2O08686 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Barx2O08686 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Barx2O08686 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Barx2O08686 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Barx2O08686 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Barx2O08686 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Barx2O08686 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Barx2O08686 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Barx2O08686 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Barx2O08686 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Barx2O08686 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Barx2O08686 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Barx2O08686 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Barx2O08686 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Barx2O08686 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Barx2O08686 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Barx2O08686 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Barx2O08686 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Barx2O08686 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Barx2O08686 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Barx2O08686 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Barx2O08686 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Barx2O08686 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Barx2O08686 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Barx2O08686 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Barx2O08686 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Barx2O08686 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Barx2O08686 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Barx2O08686 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Barx2O08686 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Barx2O08686 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Barx2O08686 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Barx2O08686 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Barx2O08686 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Barx2O08686 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Barx2O08686 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Barx2O08686 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Barx2O08686 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Barx2O08686 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Barx2O08686 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Barx2O08686 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Barx2O08686 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Barx2O08686 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Barx2O08686 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Barx2O08686 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Barx2O08686 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Barx2O08686 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Barx2O08686 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Barx2O08686 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Barx2O08686 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Barx2O08686 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Barx2O08686 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Barx2O08686 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Barx2O08686 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Barx2O08686 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Barx2O08686 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Barx2O08686 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Barx2O08686 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Barx2O08686 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Barx2O08686 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Barx2O08686 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Barx2O08686 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Barx2O08686 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Barx2O08686 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Barx2O08686 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Barx2O08686 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Barx2O08686 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Barx2O08686 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Barx2O08686 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Barx2O08686 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Barx2O08686 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Barx2O08686 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Barx2O08686 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Barx2O08686 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Barx2O08686 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Barx2O08686 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Barx2O08686 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Barx2O08686 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Barx2O08686 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Barx2O08686 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Barx2O08686 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Barx2O08686 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Barx2O08686 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Barx2O08686 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Barx2O08686 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Barx2O08686 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Barx2O08686 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Barx2O08686 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Barx2O08686 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Barx2O08686 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Barx2O08686 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Barx2O08686 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.9 ms