Protein–RNA interactions for Protein: O08665

Sema3a, Semaphorin-3A, mousemouse

Predictions only

Length 772 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema3aO08665 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Sema3aO08665 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sema3aO08665 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sema3aO08665 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sema3aO08665 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sema3aO08665 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sema3aO08665 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sema3aO08665 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sema3aO08665 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sema3aO08665 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sema3aO08665 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sema3aO08665 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sema3aO08665 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sema3aO08665 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sema3aO08665 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sema3aO08665 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sema3aO08665 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sema3aO08665 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sema3aO08665 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sema3aO08665 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sema3aO08665 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sema3aO08665 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sema3aO08665 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sema3aO08665 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sema3aO08665 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sema3aO08665 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sema3aO08665 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sema3aO08665 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sema3aO08665 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sema3aO08665 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sema3aO08665 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sema3aO08665 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sema3aO08665 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sema3aO08665 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sema3aO08665 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sema3aO08665 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sema3aO08665 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sema3aO08665 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sema3aO08665 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sema3aO08665 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Sema3aO08665 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sema3aO08665 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Sema3aO08665 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sema3aO08665 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sema3aO08665 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sema3aO08665 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sema3aO08665 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sema3aO08665 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sema3aO08665 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sema3aO08665 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sema3aO08665 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sema3aO08665 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sema3aO08665 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sema3aO08665 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sema3aO08665 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sema3aO08665 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Sema3aO08665 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Sema3aO08665 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Sema3aO08665 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Sema3aO08665 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Sema3aO08665 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Sema3aO08665 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Sema3aO08665 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sema3aO08665 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sema3aO08665 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sema3aO08665 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sema3aO08665 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sema3aO08665 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sema3aO08665 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Sema3aO08665 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sema3aO08665 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Sema3aO08665 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Sema3aO08665 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sema3aO08665 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sema3aO08665 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sema3aO08665 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sema3aO08665 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sema3aO08665 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sema3aO08665 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sema3aO08665 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sema3aO08665 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sema3aO08665 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sema3aO08665 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sema3aO08665 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sema3aO08665 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sema3aO08665 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sema3aO08665 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sema3aO08665 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sema3aO08665 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sema3aO08665 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sema3aO08665 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sema3aO08665 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sema3aO08665 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sema3aO08665 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sema3aO08665 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sema3aO08665 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sema3aO08665 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sema3aO08665 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Sema3aO08665 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Sema3aO08665 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.6 ms