Protein–RNA interactions for Protein: O08601

Mttp, Microsomal triglyceride transfer protein large subunit, mousemouse

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Length 894 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MttpO08601 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
MttpO08601 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
MttpO08601 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
MttpO08601 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
MttpO08601 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
MttpO08601 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
MttpO08601 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
MttpO08601 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
MttpO08601 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
MttpO08601 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
MttpO08601 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
MttpO08601 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
MttpO08601 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
MttpO08601 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
MttpO08601 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
MttpO08601 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
MttpO08601 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
MttpO08601 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
MttpO08601 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
MttpO08601 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
MttpO08601 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
MttpO08601 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
MttpO08601 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
MttpO08601 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
MttpO08601 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
MttpO08601 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
MttpO08601 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
MttpO08601 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
MttpO08601 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
MttpO08601 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
MttpO08601 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
MttpO08601 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
MttpO08601 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
MttpO08601 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
MttpO08601 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
MttpO08601 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
MttpO08601 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
MttpO08601 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
MttpO08601 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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MttpO08601 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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MttpO08601 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
MttpO08601 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
MttpO08601 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
MttpO08601 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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MttpO08601 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
MttpO08601 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
MttpO08601 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
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MttpO08601 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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MttpO08601 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
MttpO08601 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
MttpO08601 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
MttpO08601 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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MttpO08601 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
MttpO08601 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
MttpO08601 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
MttpO08601 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
MttpO08601 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
MttpO08601 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
MttpO08601 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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MttpO08601 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
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MttpO08601 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
MttpO08601 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
MttpO08601 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
MttpO08601 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
MttpO08601 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
MttpO08601 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
MttpO08601 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
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MttpO08601 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
MttpO08601 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
MttpO08601 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
MttpO08601 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
MttpO08601 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
MttpO08601 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
MttpO08601 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
MttpO08601 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
MttpO08601 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
MttpO08601 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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