Protein–RNA interactions for Protein: O08583

Alyref, THO complex subunit 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 255 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AlyrefO08583 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
AlyrefO08583 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
AlyrefO08583 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
AlyrefO08583 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
AlyrefO08583 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
AlyrefO08583 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
AlyrefO08583 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
AlyrefO08583 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
AlyrefO08583 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
AlyrefO08583 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
AlyrefO08583 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
AlyrefO08583 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
AlyrefO08583 Gm11628-201ENSMUST00000117568 171 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
AlyrefO08583 Sumo2-203ENSMUST00000117589 987 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
AlyrefO08583 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
AlyrefO08583 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
AlyrefO08583 Tmem255b-202ENSMUST00000167505 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
AlyrefO08583 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
AlyrefO08583 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
AlyrefO08583 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
AlyrefO08583 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
AlyrefO08583 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
AlyrefO08583 CT573034.1-201ENSMUST00000222983 313 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
AlyrefO08583 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
AlyrefO08583 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
AlyrefO08583 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
AlyrefO08583 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
AlyrefO08583 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
AlyrefO08583 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
AlyrefO08583 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
AlyrefO08583 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
AlyrefO08583 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
AlyrefO08583 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
AlyrefO08583 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
AlyrefO08583 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
AlyrefO08583 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
AlyrefO08583 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
AlyrefO08583 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
AlyrefO08583 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
AlyrefO08583 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
AlyrefO08583 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
AlyrefO08583 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
AlyrefO08583 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
AlyrefO08583 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
AlyrefO08583 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
AlyrefO08583 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
AlyrefO08583 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
AlyrefO08583 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
AlyrefO08583 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
AlyrefO08583 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
AlyrefO08583 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
AlyrefO08583 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
AlyrefO08583 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
AlyrefO08583 Eif3i-201ENSMUST00000102593 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
AlyrefO08583 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
AlyrefO08583 Gm15351-201ENSMUST00000123920 419 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
AlyrefO08583 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
AlyrefO08583 Hnf4aos-203ENSMUST00000141329 839 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
AlyrefO08583 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
AlyrefO08583 Rpl7a-ps10-201ENSMUST00000190579 798 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
AlyrefO08583 CU024892.2-201ENSMUST00000224608 832 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
AlyrefO08583 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
AlyrefO08583 Rpl7a-ps3-201ENSMUST00000090170 796 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
AlyrefO08583 Rpl7a-ps5-201ENSMUST00000095218 807 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
AlyrefO08583 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
AlyrefO08583 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
AlyrefO08583 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
AlyrefO08583 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
AlyrefO08583 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
AlyrefO08583 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
AlyrefO08583 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
AlyrefO08583 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
AlyrefO08583 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
AlyrefO08583 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
AlyrefO08583 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
AlyrefO08583 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
AlyrefO08583 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
AlyrefO08583 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
AlyrefO08583 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.07
AlyrefO08583 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
AlyrefO08583 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
AlyrefO08583 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
AlyrefO08583 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
AlyrefO08583 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
AlyrefO08583 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
AlyrefO08583 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
AlyrefO08583 Gm5187-201ENSMUST00000117317 991 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
AlyrefO08583 Gm829-202ENSMUST00000146622 722 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
AlyrefO08583 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
AlyrefO08583 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
AlyrefO08583 Gm38266-201ENSMUST00000194931 421 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
AlyrefO08583 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
AlyrefO08583 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
AlyrefO08583 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
AlyrefO08583 Rpl7-201ENSMUST00000058437 1163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
AlyrefO08583 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
AlyrefO08583 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
AlyrefO08583 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
AlyrefO08583 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
AlyrefO08583 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
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