Protein–RNA interactions for Protein: M0QWN7

Usp35, Ubiquitin-specific peptidase 35, mousemouse

Predictions only

Length 1,009 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp35M0QWN7 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Usp35M0QWN7 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Usp35M0QWN7 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Usp35M0QWN7 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Usp35M0QWN7 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp35M0QWN7 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp35M0QWN7 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp35M0QWN7 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp35M0QWN7 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp35M0QWN7 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp35M0QWN7 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp35M0QWN7 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp35M0QWN7 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp35M0QWN7 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp35M0QWN7 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp35M0QWN7 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp35M0QWN7 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp35M0QWN7 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp35M0QWN7 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp35M0QWN7 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp35M0QWN7 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp35M0QWN7 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp35M0QWN7 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp35M0QWN7 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp35M0QWN7 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp35M0QWN7 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp35M0QWN7 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp35M0QWN7 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp35M0QWN7 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp35M0QWN7 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp35M0QWN7 Col22a1-202ENSMUST00000159993 8809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp35M0QWN7 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp35M0QWN7 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp35M0QWN7 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp35M0QWN7 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp35M0QWN7 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp35M0QWN7 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp35M0QWN7 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp35M0QWN7 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp35M0QWN7 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp35M0QWN7 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp35M0QWN7 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp35M0QWN7 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp35M0QWN7 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp35M0QWN7 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp35M0QWN7 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp35M0QWN7 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp35M0QWN7 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp35M0QWN7 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp35M0QWN7 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp35M0QWN7 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp35M0QWN7 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp35M0QWN7 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp35M0QWN7 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp35M0QWN7 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp35M0QWN7 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp35M0QWN7 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp35M0QWN7 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp35M0QWN7 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp35M0QWN7 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp35M0QWN7 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp35M0QWN7 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp35M0QWN7 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp35M0QWN7 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp35M0QWN7 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp35M0QWN7 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp35M0QWN7 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp35M0QWN7 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp35M0QWN7 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp35M0QWN7 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp35M0QWN7 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp35M0QWN7 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp35M0QWN7 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp35M0QWN7 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp35M0QWN7 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp35M0QWN7 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp35M0QWN7 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp35M0QWN7 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp35M0QWN7 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp35M0QWN7 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp35M0QWN7 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp35M0QWN7 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp35M0QWN7 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp35M0QWN7 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp35M0QWN7 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp35M0QWN7 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp35M0QWN7 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp35M0QWN7 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp35M0QWN7 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp35M0QWN7 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp35M0QWN7 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp35M0QWN7 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp35M0QWN7 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp35M0QWN7 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp35M0QWN7 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp35M0QWN7 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp35M0QWN7 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp35M0QWN7 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp35M0QWN7 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp35M0QWN7 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms