Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ19

Gm379, Predicted gene 379, mousemouse

Predictions only

Length 296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm379J3QQ19 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Gm379J3QQ19 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Gm379J3QQ19 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Gm379J3QQ19 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Gm379J3QQ19 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Gm379J3QQ19 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Gm379J3QQ19 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Gm379J3QQ19 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Gm379J3QQ19 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Gm379J3QQ19 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Gm379J3QQ19 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Gm379J3QQ19 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Gm379J3QQ19 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Gm379J3QQ19 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Gm379J3QQ19 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Gm379J3QQ19 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Gm379J3QQ19 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Gm379J3QQ19 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Gm379J3QQ19 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
Gm379J3QQ19 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Gm379J3QQ19 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Gm379J3QQ19 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Gm379J3QQ19 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Gm379J3QQ19 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Gm379J3QQ19 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Gm379J3QQ19 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Gm379J3QQ19 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Gm379J3QQ19 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Gm379J3QQ19 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Gm379J3QQ19 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Gm379J3QQ19 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Gm379J3QQ19 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
Gm379J3QQ19 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Gm379J3QQ19 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Gm379J3QQ19 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Gm379J3QQ19 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Gm379J3QQ19 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Gm379J3QQ19 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Gm379J3QQ19 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Gm379J3QQ19 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
Gm379J3QQ19 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Gm379J3QQ19 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Gm379J3QQ19 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Gm379J3QQ19 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Gm379J3QQ19 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Gm379J3QQ19 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Gm379J3QQ19 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Gm379J3QQ19 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Gm379J3QQ19 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Gm379J3QQ19 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Gm379J3QQ19 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Gm379J3QQ19 Ephb3-201ENSMUST00000006112 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Gm379J3QQ19 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Gm379J3QQ19 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Gm379J3QQ19 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Gm379J3QQ19 Cfap69-201ENSMUST00000054865 4956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Gm379J3QQ19 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Gm379J3QQ19 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Gm379J3QQ19 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Gm379J3QQ19 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Gm379J3QQ19 Dhx37-201ENSMUST00000169485 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Gm379J3QQ19 C5ar1-201ENSMUST00000050770 2481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Gm379J3QQ19 Arhgap33-207ENSMUST00000208538 4372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Gm379J3QQ19 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Gm379J3QQ19 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Gm379J3QQ19 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Gm379J3QQ19 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Gm379J3QQ19 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Gm379J3QQ19 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Gm379J3QQ19 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Gm379J3QQ19 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Gm379J3QQ19 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Gm379J3QQ19 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Gm379J3QQ19 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Gm379J3QQ19 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Gm379J3QQ19 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Gm379J3QQ19 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Gm379J3QQ19 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Gm379J3QQ19 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Gm379J3QQ19 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Gm379J3QQ19 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Gm379J3QQ19 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Gm379J3QQ19 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Gm379J3QQ19 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm379J3QQ19 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm379J3QQ19 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm379J3QQ19 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm379J3QQ19 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm379J3QQ19 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm379J3QQ19 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm379J3QQ19 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm379J3QQ19 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm379J3QQ19 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm379J3QQ19 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm379J3QQ19 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm379J3QQ19 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm379J3QQ19 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm379J3QQ19 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm379J3QQ19 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm379J3QQ19 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.2 ms