Protein–RNA interactions for Protein: J3QNE4

Ccdc180, Coiled-coil domain-containing 180, mousemouse

Predictions only

Length 1,664 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc180J3QNE4 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ccdc180J3QNE4 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ccdc180J3QNE4 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
Ccdc180J3QNE4 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ccdc180J3QNE4 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ccdc180J3QNE4 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ccdc180J3QNE4 Gm27514-201ENSMUST00000183692 110 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
Ccdc180J3QNE4 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
Ccdc180J3QNE4 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ccdc180J3QNE4 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ccdc180J3QNE4 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ccdc180J3QNE4 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ccdc180J3QNE4 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ccdc180J3QNE4 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
Ccdc180J3QNE4 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ccdc180J3QNE4 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ccdc180J3QNE4 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ccdc180J3QNE4 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ccdc180J3QNE4 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ccdc180J3QNE4 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ccdc180J3QNE4 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ccdc180J3QNE4 Gm10478-201ENSMUST00000084451 396 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
Ccdc180J3QNE4 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Ccdc180J3QNE4 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Ccdc180J3QNE4 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
Ccdc180J3QNE4 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Ccdc180J3QNE4 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Ccdc180J3QNE4 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Ccdc180J3QNE4 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Ccdc180J3QNE4 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Ccdc180J3QNE4 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Ccdc180J3QNE4 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Ccdc180J3QNE4 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Ccdc180J3QNE4 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Ccdc180J3QNE4 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Ccdc180J3QNE4 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Ccdc180J3QNE4 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Ccdc180J3QNE4 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Ccdc180J3QNE4 Gm38319-201ENSMUST00000194537 1266 ntBASIC25.89■■□□□ 1.73
Ccdc180J3QNE4 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
Ccdc180J3QNE4 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Ccdc180J3QNE4 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC25.89■■□□□ 1.73
Ccdc180J3QNE4 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Ccdc180J3QNE4 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Ccdc180J3QNE4 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
Ccdc180J3QNE4 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Ccdc180J3QNE4 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Ccdc180J3QNE4 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ccdc180J3QNE4 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ccdc180J3QNE4 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ccdc180J3QNE4 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ccdc180J3QNE4 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ccdc180J3QNE4 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ccdc180J3QNE4 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ccdc180J3QNE4 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
Ccdc180J3QNE4 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ccdc180J3QNE4 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ccdc180J3QNE4 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ccdc180J3QNE4 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ccdc180J3QNE4 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ccdc180J3QNE4 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ccdc180J3QNE4 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ccdc180J3QNE4 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
Ccdc180J3QNE4 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ccdc180J3QNE4 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ccdc180J3QNE4 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ccdc180J3QNE4 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ccdc180J3QNE4 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ccdc180J3QNE4 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ccdc180J3QNE4 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ccdc180J3QNE4 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ccdc180J3QNE4 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ccdc180J3QNE4 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ccdc180J3QNE4 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ccdc180J3QNE4 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ccdc180J3QNE4 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ccdc180J3QNE4 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ccdc180J3QNE4 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ccdc180J3QNE4 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
Ccdc180J3QNE4 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ccdc180J3QNE4 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ccdc180J3QNE4 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ccdc180J3QNE4 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ccdc180J3QNE4 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ccdc180J3QNE4 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ccdc180J3QNE4 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ccdc180J3QNE4 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ccdc180J3QNE4 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ccdc180J3QNE4 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ccdc180J3QNE4 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ccdc180J3QNE4 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ccdc180J3QNE4 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ccdc180J3QNE4 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ccdc180J3QNE4 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ccdc180J3QNE4 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ccdc180J3QNE4 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ccdc180J3QNE4 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ccdc180J3QNE4 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ccdc180J3QNE4 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ccdc180J3QNE4 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms