Protein–RNA interactions for Protein: J3QMY9

Top6bl, Type 2 DNA topoisomerase 6 subunit B-like, mousemouse

Predictions only

Length 579 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top6blJ3QMY9 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Top6blJ3QMY9 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Top6blJ3QMY9 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Top6blJ3QMY9 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Top6blJ3QMY9 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Top6blJ3QMY9 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Top6blJ3QMY9 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Top6blJ3QMY9 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Top6blJ3QMY9 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Top6blJ3QMY9 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Top6blJ3QMY9 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Top6blJ3QMY9 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Top6blJ3QMY9 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Top6blJ3QMY9 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Top6blJ3QMY9 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Top6blJ3QMY9 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Top6blJ3QMY9 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Top6blJ3QMY9 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Top6blJ3QMY9 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Top6blJ3QMY9 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Top6blJ3QMY9 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Top6blJ3QMY9 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Top6blJ3QMY9 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Top6blJ3QMY9 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Top6blJ3QMY9 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Top6blJ3QMY9 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Top6blJ3QMY9 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Top6blJ3QMY9 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Top6blJ3QMY9 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Top6blJ3QMY9 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Top6blJ3QMY9 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Top6blJ3QMY9 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Top6blJ3QMY9 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Top6blJ3QMY9 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Top6blJ3QMY9 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Top6blJ3QMY9 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Top6blJ3QMY9 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Top6blJ3QMY9 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Top6blJ3QMY9 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Top6blJ3QMY9 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Top6blJ3QMY9 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Top6blJ3QMY9 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Top6blJ3QMY9 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Top6blJ3QMY9 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Top6blJ3QMY9 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Top6blJ3QMY9 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Top6blJ3QMY9 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Top6blJ3QMY9 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.07■□□□□ 0
Top6blJ3QMY9 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Top6blJ3QMY9 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Top6blJ3QMY9 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Top6blJ3QMY9 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Top6blJ3QMY9 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Top6blJ3QMY9 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Top6blJ3QMY9 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Top6blJ3QMY9 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Top6blJ3QMY9 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Top6blJ3QMY9 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Top6blJ3QMY9 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Top6blJ3QMY9 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Top6blJ3QMY9 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Top6blJ3QMY9 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Top6blJ3QMY9 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Top6blJ3QMY9 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Top6blJ3QMY9 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Top6blJ3QMY9 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Top6blJ3QMY9 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Top6blJ3QMY9 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Top6blJ3QMY9 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Top6blJ3QMY9 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Top6blJ3QMY9 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Top6blJ3QMY9 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Top6blJ3QMY9 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Top6blJ3QMY9 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Top6blJ3QMY9 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Top6blJ3QMY9 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Top6blJ3QMY9 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Top6blJ3QMY9 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Top6blJ3QMY9 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Top6blJ3QMY9 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Top6blJ3QMY9 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Top6blJ3QMY9 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.06■□□□□ 0
Top6blJ3QMY9 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Top6blJ3QMY9 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Top6blJ3QMY9 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Top6blJ3QMY9 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Top6blJ3QMY9 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Top6blJ3QMY9 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Top6blJ3QMY9 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Top6blJ3QMY9 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Top6blJ3QMY9 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Top6blJ3QMY9 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Top6blJ3QMY9 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Top6blJ3QMY9 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Top6blJ3QMY9 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Top6blJ3QMY9 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Top6blJ3QMY9 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Top6blJ3QMY9 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Top6blJ3QMY9 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Top6blJ3QMY9 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.5 ms