Protein–RNA interactions for Protein: J3QMS9

E030018B13Rik, RIKEN cDNA E030018B13 gene, mousemouse

Predictions only

Length 113 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E030018B13RikJ3QMS9 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
E030018B13RikJ3QMS9 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
E030018B13RikJ3QMS9 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
E030018B13RikJ3QMS9 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
E030018B13RikJ3QMS9 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
E030018B13RikJ3QMS9 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
E030018B13RikJ3QMS9 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
E030018B13RikJ3QMS9 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
E030018B13RikJ3QMS9 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
E030018B13RikJ3QMS9 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
E030018B13RikJ3QMS9 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
E030018B13RikJ3QMS9 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
E030018B13RikJ3QMS9 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
E030018B13RikJ3QMS9 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
E030018B13RikJ3QMS9 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
E030018B13RikJ3QMS9 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
E030018B13RikJ3QMS9 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
E030018B13RikJ3QMS9 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
E030018B13RikJ3QMS9 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
E030018B13RikJ3QMS9 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
E030018B13RikJ3QMS9 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
E030018B13RikJ3QMS9 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
E030018B13RikJ3QMS9 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
E030018B13RikJ3QMS9 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
E030018B13RikJ3QMS9 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
E030018B13RikJ3QMS9 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
E030018B13RikJ3QMS9 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
E030018B13RikJ3QMS9 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
E030018B13RikJ3QMS9 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
E030018B13RikJ3QMS9 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
E030018B13RikJ3QMS9 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
E030018B13RikJ3QMS9 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
E030018B13RikJ3QMS9 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
E030018B13RikJ3QMS9 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
E030018B13RikJ3QMS9 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
E030018B13RikJ3QMS9 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
E030018B13RikJ3QMS9 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
E030018B13RikJ3QMS9 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
E030018B13RikJ3QMS9 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
E030018B13RikJ3QMS9 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
E030018B13RikJ3QMS9 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
E030018B13RikJ3QMS9 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
E030018B13RikJ3QMS9 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
E030018B13RikJ3QMS9 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
E030018B13RikJ3QMS9 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
E030018B13RikJ3QMS9 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
E030018B13RikJ3QMS9 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
E030018B13RikJ3QMS9 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
E030018B13RikJ3QMS9 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
E030018B13RikJ3QMS9 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
E030018B13RikJ3QMS9 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
E030018B13RikJ3QMS9 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
E030018B13RikJ3QMS9 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
E030018B13RikJ3QMS9 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
E030018B13RikJ3QMS9 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
E030018B13RikJ3QMS9 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
E030018B13RikJ3QMS9 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
E030018B13RikJ3QMS9 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
E030018B13RikJ3QMS9 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
E030018B13RikJ3QMS9 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
E030018B13RikJ3QMS9 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
E030018B13RikJ3QMS9 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
E030018B13RikJ3QMS9 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
E030018B13RikJ3QMS9 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
E030018B13RikJ3QMS9 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
E030018B13RikJ3QMS9 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
E030018B13RikJ3QMS9 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
E030018B13RikJ3QMS9 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
E030018B13RikJ3QMS9 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
E030018B13RikJ3QMS9 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
E030018B13RikJ3QMS9 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
E030018B13RikJ3QMS9 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
E030018B13RikJ3QMS9 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
E030018B13RikJ3QMS9 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
E030018B13RikJ3QMS9 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
E030018B13RikJ3QMS9 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
E030018B13RikJ3QMS9 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
E030018B13RikJ3QMS9 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
E030018B13RikJ3QMS9 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
E030018B13RikJ3QMS9 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
E030018B13RikJ3QMS9 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
E030018B13RikJ3QMS9 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
E030018B13RikJ3QMS9 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
E030018B13RikJ3QMS9 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
E030018B13RikJ3QMS9 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
E030018B13RikJ3QMS9 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
E030018B13RikJ3QMS9 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
E030018B13RikJ3QMS9 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
E030018B13RikJ3QMS9 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
E030018B13RikJ3QMS9 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
E030018B13RikJ3QMS9 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
E030018B13RikJ3QMS9 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
E030018B13RikJ3QMS9 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
E030018B13RikJ3QMS9 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
E030018B13RikJ3QMS9 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
E030018B13RikJ3QMS9 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
E030018B13RikJ3QMS9 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
E030018B13RikJ3QMS9 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
E030018B13RikJ3QMS9 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
E030018B13RikJ3QMS9 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms