Protein–RNA interactions for Protein: J3QK56

4930544D05Rik, RIKEN cDNA 4930544D05 gene, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930544D05RikJ3QK56 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
4930544D05RikJ3QK56 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
4930544D05RikJ3QK56 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
4930544D05RikJ3QK56 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
4930544D05RikJ3QK56 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
4930544D05RikJ3QK56 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
4930544D05RikJ3QK56 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
4930544D05RikJ3QK56 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
4930544D05RikJ3QK56 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
4930544D05RikJ3QK56 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
4930544D05RikJ3QK56 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
4930544D05RikJ3QK56 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
4930544D05RikJ3QK56 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
4930544D05RikJ3QK56 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
4930544D05RikJ3QK56 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
4930544D05RikJ3QK56 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
4930544D05RikJ3QK56 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
4930544D05RikJ3QK56 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
4930544D05RikJ3QK56 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
4930544D05RikJ3QK56 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
4930544D05RikJ3QK56 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
4930544D05RikJ3QK56 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
4930544D05RikJ3QK56 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
4930544D05RikJ3QK56 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
4930544D05RikJ3QK56 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
4930544D05RikJ3QK56 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
4930544D05RikJ3QK56 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
4930544D05RikJ3QK56 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
4930544D05RikJ3QK56 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
4930544D05RikJ3QK56 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
4930544D05RikJ3QK56 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
4930544D05RikJ3QK56 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
4930544D05RikJ3QK56 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
4930544D05RikJ3QK56 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
4930544D05RikJ3QK56 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
4930544D05RikJ3QK56 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
4930544D05RikJ3QK56 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
4930544D05RikJ3QK56 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
4930544D05RikJ3QK56 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
4930544D05RikJ3QK56 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
4930544D05RikJ3QK56 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
4930544D05RikJ3QK56 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
4930544D05RikJ3QK56 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
4930544D05RikJ3QK56 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
4930544D05RikJ3QK56 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
4930544D05RikJ3QK56 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
4930544D05RikJ3QK56 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
4930544D05RikJ3QK56 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
4930544D05RikJ3QK56 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
4930544D05RikJ3QK56 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
4930544D05RikJ3QK56 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
4930544D05RikJ3QK56 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
4930544D05RikJ3QK56 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
4930544D05RikJ3QK56 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
4930544D05RikJ3QK56 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
4930544D05RikJ3QK56 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
4930544D05RikJ3QK56 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
4930544D05RikJ3QK56 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
4930544D05RikJ3QK56 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
4930544D05RikJ3QK56 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
4930544D05RikJ3QK56 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
4930544D05RikJ3QK56 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
4930544D05RikJ3QK56 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
4930544D05RikJ3QK56 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
4930544D05RikJ3QK56 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
4930544D05RikJ3QK56 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
4930544D05RikJ3QK56 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
4930544D05RikJ3QK56 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
4930544D05RikJ3QK56 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
4930544D05RikJ3QK56 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
4930544D05RikJ3QK56 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
4930544D05RikJ3QK56 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
4930544D05RikJ3QK56 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
4930544D05RikJ3QK56 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
4930544D05RikJ3QK56 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
4930544D05RikJ3QK56 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
4930544D05RikJ3QK56 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
4930544D05RikJ3QK56 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
4930544D05RikJ3QK56 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
4930544D05RikJ3QK56 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
4930544D05RikJ3QK56 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
4930544D05RikJ3QK56 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
4930544D05RikJ3QK56 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
4930544D05RikJ3QK56 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
4930544D05RikJ3QK56 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
4930544D05RikJ3QK56 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
4930544D05RikJ3QK56 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
4930544D05RikJ3QK56 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
4930544D05RikJ3QK56 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
4930544D05RikJ3QK56 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
4930544D05RikJ3QK56 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
4930544D05RikJ3QK56 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
4930544D05RikJ3QK56 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
4930544D05RikJ3QK56 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
4930544D05RikJ3QK56 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
4930544D05RikJ3QK56 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
4930544D05RikJ3QK56 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
4930544D05RikJ3QK56 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
4930544D05RikJ3QK56 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
4930544D05RikJ3QK56 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms