Protein–RNA interactions for Protein: J3QJW5

Cldn34c3, Claudin 34C3, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34c3J3QJW5 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cldn34c3J3QJW5 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cldn34c3J3QJW5 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cldn34c3J3QJW5 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cldn34c3J3QJW5 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cldn34c3J3QJW5 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cldn34c3J3QJW5 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cldn34c3J3QJW5 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cldn34c3J3QJW5 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Cldn34c3J3QJW5 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cldn34c3J3QJW5 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cldn34c3J3QJW5 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cldn34c3J3QJW5 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cldn34c3J3QJW5 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cldn34c3J3QJW5 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cldn34c3J3QJW5 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cldn34c3J3QJW5 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cldn34c3J3QJW5 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cldn34c3J3QJW5 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cldn34c3J3QJW5 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cldn34c3J3QJW5 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cldn34c3J3QJW5 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cldn34c3J3QJW5 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cldn34c3J3QJW5 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cldn34c3J3QJW5 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cldn34c3J3QJW5 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cldn34c3J3QJW5 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cldn34c3J3QJW5 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Cldn34c3J3QJW5 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cldn34c3J3QJW5 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cldn34c3J3QJW5 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cldn34c3J3QJW5 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cldn34c3J3QJW5 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cldn34c3J3QJW5 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cldn34c3J3QJW5 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cldn34c3J3QJW5 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cldn34c3J3QJW5 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cldn34c3J3QJW5 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cldn34c3J3QJW5 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cldn34c3J3QJW5 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cldn34c3J3QJW5 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cldn34c3J3QJW5 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cldn34c3J3QJW5 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cldn34c3J3QJW5 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cldn34c3J3QJW5 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cldn34c3J3QJW5 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Cldn34c3J3QJW5 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cldn34c3J3QJW5 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cldn34c3J3QJW5 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Cldn34c3J3QJW5 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cldn34c3J3QJW5 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Cldn34c3J3QJW5 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Cldn34c3J3QJW5 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cldn34c3J3QJW5 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cldn34c3J3QJW5 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cldn34c3J3QJW5 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cldn34c3J3QJW5 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cldn34c3J3QJW5 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cldn34c3J3QJW5 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cldn34c3J3QJW5 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cldn34c3J3QJW5 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cldn34c3J3QJW5 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cldn34c3J3QJW5 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cldn34c3J3QJW5 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cldn34c3J3QJW5 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cldn34c3J3QJW5 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cldn34c3J3QJW5 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cldn34c3J3QJW5 Nwd2-201ENSMUST00000159584 8534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cldn34c3J3QJW5 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cldn34c3J3QJW5 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cldn34c3J3QJW5 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cldn34c3J3QJW5 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cldn34c3J3QJW5 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cldn34c3J3QJW5 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cldn34c3J3QJW5 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
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Cldn34c3J3QJW5 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Cldn34c3J3QJW5 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cldn34c3J3QJW5 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Cldn34c3J3QJW5 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cldn34c3J3QJW5 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Cldn34c3J3QJW5 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cldn34c3J3QJW5 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cldn34c3J3QJW5 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cldn34c3J3QJW5 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cldn34c3J3QJW5 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cldn34c3J3QJW5 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cldn34c3J3QJW5 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cldn34c3J3QJW5 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cldn34c3J3QJW5 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cldn34c3J3QJW5 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cldn34c3J3QJW5 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cldn34c3J3QJW5 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cldn34c3J3QJW5 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cldn34c3J3QJW5 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cldn34c3J3QJW5 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cldn34c3J3QJW5 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cldn34c3J3QJW5 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cldn34c3J3QJW5 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cldn34c3J3QJW5 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
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