Protein–RNA interactions for Protein: J3KMU4

Gm21060, Predicted gene, 21060, mousemouse

Predictions only

Length 56 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21060J3KMU4 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm21060J3KMU4 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm21060J3KMU4 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm21060J3KMU4 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm21060J3KMU4 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm21060J3KMU4 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm21060J3KMU4 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm21060J3KMU4 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm21060J3KMU4 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm21060J3KMU4 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm21060J3KMU4 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm21060J3KMU4 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm21060J3KMU4 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm21060J3KMU4 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm21060J3KMU4 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm21060J3KMU4 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm21060J3KMU4 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm21060J3KMU4 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm21060J3KMU4 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm21060J3KMU4 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm21060J3KMU4 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm21060J3KMU4 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm21060J3KMU4 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm21060J3KMU4 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm21060J3KMU4 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm21060J3KMU4 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm21060J3KMU4 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm21060J3KMU4 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm21060J3KMU4 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm21060J3KMU4 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm21060J3KMU4 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm21060J3KMU4 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm21060J3KMU4 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm21060J3KMU4 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm21060J3KMU4 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm21060J3KMU4 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm21060J3KMU4 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm21060J3KMU4 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm21060J3KMU4 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm21060J3KMU4 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm21060J3KMU4 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm21060J3KMU4 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm21060J3KMU4 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm21060J3KMU4 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm21060J3KMU4 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm21060J3KMU4 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm21060J3KMU4 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm21060J3KMU4 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm21060J3KMU4 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm21060J3KMU4 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm21060J3KMU4 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm21060J3KMU4 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm21060J3KMU4 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm21060J3KMU4 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm21060J3KMU4 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm21060J3KMU4 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm21060J3KMU4 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm21060J3KMU4 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm21060J3KMU4 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm21060J3KMU4 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm21060J3KMU4 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm21060J3KMU4 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm21060J3KMU4 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm21060J3KMU4 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm21060J3KMU4 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm21060J3KMU4 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm21060J3KMU4 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm21060J3KMU4 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm21060J3KMU4 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm21060J3KMU4 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm21060J3KMU4 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm21060J3KMU4 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm21060J3KMU4 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm21060J3KMU4 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm21060J3KMU4 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm21060J3KMU4 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm21060J3KMU4 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm21060J3KMU4 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm21060J3KMU4 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm21060J3KMU4 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm21060J3KMU4 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm21060J3KMU4 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm21060J3KMU4 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm21060J3KMU4 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm21060J3KMU4 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm21060J3KMU4 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm21060J3KMU4 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm21060J3KMU4 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm21060J3KMU4 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm21060J3KMU4 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm21060J3KMU4 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm21060J3KMU4 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm21060J3KMU4 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm21060J3KMU4 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm21060J3KMU4 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm21060J3KMU4 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm21060J3KMU4 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm21060J3KMU4 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm21060J3KMU4 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm21060J3KMU4 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
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