Protein–RNA interactions for Protein: G3X912

Sprtn, SprT-like domain-containing protein Spartan, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SprtnG3X912 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SprtnG3X912 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SprtnG3X912 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SprtnG3X912 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SprtnG3X912 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SprtnG3X912 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SprtnG3X912 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SprtnG3X912 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SprtnG3X912 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SprtnG3X912 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SprtnG3X912 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SprtnG3X912 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SprtnG3X912 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SprtnG3X912 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SprtnG3X912 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SprtnG3X912 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SprtnG3X912 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SprtnG3X912 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SprtnG3X912 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SprtnG3X912 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SprtnG3X912 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SprtnG3X912 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SprtnG3X912 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SprtnG3X912 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SprtnG3X912 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SprtnG3X912 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SprtnG3X912 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SprtnG3X912 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SprtnG3X912 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SprtnG3X912 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SprtnG3X912 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SprtnG3X912 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SprtnG3X912 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SprtnG3X912 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SprtnG3X912 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SprtnG3X912 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SprtnG3X912 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SprtnG3X912 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SprtnG3X912 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SprtnG3X912 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SprtnG3X912 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SprtnG3X912 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SprtnG3X912 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SprtnG3X912 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SprtnG3X912 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SprtnG3X912 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SprtnG3X912 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SprtnG3X912 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SprtnG3X912 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SprtnG3X912 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SprtnG3X912 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SprtnG3X912 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SprtnG3X912 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SprtnG3X912 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SprtnG3X912 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SprtnG3X912 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SprtnG3X912 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SprtnG3X912 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SprtnG3X912 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SprtnG3X912 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SprtnG3X912 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SprtnG3X912 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SprtnG3X912 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SprtnG3X912 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SprtnG3X912 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SprtnG3X912 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SprtnG3X912 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SprtnG3X912 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SprtnG3X912 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SprtnG3X912 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SprtnG3X912 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SprtnG3X912 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SprtnG3X912 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SprtnG3X912 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SprtnG3X912 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SprtnG3X912 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SprtnG3X912 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SprtnG3X912 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SprtnG3X912 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SprtnG3X912 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SprtnG3X912 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SprtnG3X912 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SprtnG3X912 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SprtnG3X912 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SprtnG3X912 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SprtnG3X912 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SprtnG3X912 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SprtnG3X912 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SprtnG3X912 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SprtnG3X912 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SprtnG3X912 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SprtnG3X912 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SprtnG3X912 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SprtnG3X912 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SprtnG3X912 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SprtnG3X912 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SprtnG3X912 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SprtnG3X912 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SprtnG3X912 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SprtnG3X912 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.9 ms