Protein–RNA interactions for Protein: G3X8Z7

Chrna9, Cholinergic receptor, nicotinic, alpha polypeptide 9, mousemouse

Predictions only

Length 479 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrna9G3X8Z7 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Chrna9G3X8Z7 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Chrna9G3X8Z7 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Chrna9G3X8Z7 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Chrna9G3X8Z7 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Chrna9G3X8Z7 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Chrna9G3X8Z7 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Chrna9G3X8Z7 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Chrna9G3X8Z7 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Chrna9G3X8Z7 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Chrna9G3X8Z7 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Chrna9G3X8Z7 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Chrna9G3X8Z7 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Chrna9G3X8Z7 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Chrna9G3X8Z7 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Chrna9G3X8Z7 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Chrna9G3X8Z7 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Chrna9G3X8Z7 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Chrna9G3X8Z7 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Chrna9G3X8Z7 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Chrna9G3X8Z7 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Chrna9G3X8Z7 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Chrna9G3X8Z7 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Chrna9G3X8Z7 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Chrna9G3X8Z7 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Chrna9G3X8Z7 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Chrna9G3X8Z7 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Chrna9G3X8Z7 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Chrna9G3X8Z7 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Chrna9G3X8Z7 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Chrna9G3X8Z7 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Chrna9G3X8Z7 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Chrna9G3X8Z7 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Chrna9G3X8Z7 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Chrna9G3X8Z7 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Chrna9G3X8Z7 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Chrna9G3X8Z7 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Chrna9G3X8Z7 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Chrna9G3X8Z7 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Chrna9G3X8Z7 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Chrna9G3X8Z7 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Chrna9G3X8Z7 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Chrna9G3X8Z7 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Chrna9G3X8Z7 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Chrna9G3X8Z7 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Chrna9G3X8Z7 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Chrna9G3X8Z7 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Chrna9G3X8Z7 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Chrna9G3X8Z7 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Chrna9G3X8Z7 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Chrna9G3X8Z7 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Chrna9G3X8Z7 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Chrna9G3X8Z7 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Chrna9G3X8Z7 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Chrna9G3X8Z7 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Chrna9G3X8Z7 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Chrna9G3X8Z7 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Chrna9G3X8Z7 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Chrna9G3X8Z7 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Chrna9G3X8Z7 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Chrna9G3X8Z7 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Chrna9G3X8Z7 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Chrna9G3X8Z7 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Chrna9G3X8Z7 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Chrna9G3X8Z7 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Chrna9G3X8Z7 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Chrna9G3X8Z7 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Chrna9G3X8Z7 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Chrna9G3X8Z7 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Chrna9G3X8Z7 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Chrna9G3X8Z7 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Chrna9G3X8Z7 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Chrna9G3X8Z7 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Chrna9G3X8Z7 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Chrna9G3X8Z7 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Chrna9G3X8Z7 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Chrna9G3X8Z7 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Chrna9G3X8Z7 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Chrna9G3X8Z7 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Chrna9G3X8Z7 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Chrna9G3X8Z7 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Chrna9G3X8Z7 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Chrna9G3X8Z7 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Chrna9G3X8Z7 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Chrna9G3X8Z7 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Chrna9G3X8Z7 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Chrna9G3X8Z7 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Chrna9G3X8Z7 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Chrna9G3X8Z7 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Chrna9G3X8Z7 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Chrna9G3X8Z7 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Chrna9G3X8Z7 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Chrna9G3X8Z7 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Chrna9G3X8Z7 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Chrna9G3X8Z7 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Chrna9G3X8Z7 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Chrna9G3X8Z7 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Chrna9G3X8Z7 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Chrna9G3X8Z7 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Chrna9G3X8Z7 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.1 ms