Protein–RNA interactions for Protein: F8VPU6

Usp9y, Ubiquitin-specific peptidase 9, Y chromosome, mousemouse

Predictions only

Length 2,556 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp9yF8VPU6 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Usp9yF8VPU6 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Usp9yF8VPU6 Gm18893-201ENSMUST00000198416 943 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Usp9yF8VPU6 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Usp9yF8VPU6 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Usp9yF8VPU6 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Usp9yF8VPU6 Ascc1-202ENSMUST00000164083 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Usp9yF8VPU6 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Usp9yF8VPU6 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Usp9yF8VPU6 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Usp9yF8VPU6 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Usp9yF8VPU6 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Usp9yF8VPU6 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Usp9yF8VPU6 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Usp9yF8VPU6 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Usp9yF8VPU6 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Usp9yF8VPU6 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Usp9yF8VPU6 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Usp9yF8VPU6 Tmed5-203ENSMUST00000117759 482 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Usp9yF8VPU6 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Usp9yF8VPU6 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Usp9yF8VPU6 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Usp9yF8VPU6 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Usp9yF8VPU6 D9Wsu149-201ENSMUST00000214169 594 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Usp9yF8VPU6 CT033793.1-201ENSMUST00000216883 565 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Usp9yF8VPU6 Nmral1-201ENSMUST00000074970 1155 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Usp9yF8VPU6 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Usp9yF8VPU6 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Usp9yF8VPU6 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Usp9yF8VPU6 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Usp9yF8VPU6 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Usp9yF8VPU6 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Usp9yF8VPU6 Prr15l-201ENSMUST00000054311 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Usp9yF8VPU6 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.59
Usp9yF8VPU6 Gm16168-201ENSMUST00000161091 1359 ntTSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.59
Usp9yF8VPU6 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Usp9yF8VPU6 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Usp9yF8VPU6 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Usp9yF8VPU6 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Usp9yF8VPU6 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Usp9yF8VPU6 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Usp9yF8VPU6 Gm8566-201ENSMUST00000120174 465 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Usp9yF8VPU6 Gm20636-201ENSMUST00000176660 707 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Usp9yF8VPU6 Gm8959-201ENSMUST00000213150 571 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Usp9yF8VPU6 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Usp9yF8VPU6 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Usp9yF8VPU6 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Usp9yF8VPU6 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Usp9yF8VPU6 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Usp9yF8VPU6 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Usp9yF8VPU6 Igbp1b-201ENSMUST00000054786 1456 ntAPPRIS P1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Usp9yF8VPU6 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Usp9yF8VPU6 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Usp9yF8VPU6 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Usp9yF8VPU6 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Usp9yF8VPU6 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Usp9yF8VPU6 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Usp9yF8VPU6 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Usp9yF8VPU6 Got2-ps1-201ENSMUST00000121655 1293 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Usp9yF8VPU6 Gm11290-201ENSMUST00000124833 396 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Usp9yF8VPU6 Ftl1-ps2-201ENSMUST00000169477 549 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Usp9yF8VPU6 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Usp9yF8VPU6 Gm26728-201ENSMUST00000185268 595 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Usp9yF8VPU6 Odf4-201ENSMUST00000038932 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Usp9yF8VPU6 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Usp9yF8VPU6 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Usp9yF8VPU6 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Usp9yF8VPU6 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Usp9yF8VPU6 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Usp9yF8VPU6 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Usp9yF8VPU6 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Usp9yF8VPU6 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Usp9yF8VPU6 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Usp9yF8VPU6 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Usp9yF8VPU6 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Usp9yF8VPU6 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Usp9yF8VPU6 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Usp9yF8VPU6 Gm36937-201ENSMUST00000192957 429 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Usp9yF8VPU6 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Usp9yF8VPU6 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Usp9yF8VPU6 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Usp9yF8VPU6 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Usp9yF8VPU6 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Usp9yF8VPU6 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Usp9yF8VPU6 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Usp9yF8VPU6 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Usp9yF8VPU6 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Usp9yF8VPU6 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Usp9yF8VPU6 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Usp9yF8VPU6 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Usp9yF8VPU6 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Usp9yF8VPU6 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Usp9yF8VPU6 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Usp9yF8VPU6 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Usp9yF8VPU6 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Usp9yF8VPU6 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Usp9yF8VPU6 Gm17376-201ENSMUST00000166016 84 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Usp9yF8VPU6 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Usp9yF8VPU6 Gm29396-201ENSMUST00000185659 716 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Usp9yF8VPU6 Gm37835-201ENSMUST00000193305 361 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
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