Protein–RNA interactions for Protein: F7CXU4

H2-M1, Histocompatibility 2, M region locus 1, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M1F7CXU4 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
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H2-M1F7CXU4 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
H2-M1F7CXU4 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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H2-M1F7CXU4 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
H2-M1F7CXU4 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
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H2-M1F7CXU4 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
H2-M1F7CXU4 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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H2-M1F7CXU4 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
H2-M1F7CXU4 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
H2-M1F7CXU4 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
H2-M1F7CXU4 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
H2-M1F7CXU4 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
H2-M1F7CXU4 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
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H2-M1F7CXU4 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
H2-M1F7CXU4 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
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H2-M1F7CXU4 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
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H2-M1F7CXU4 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
H2-M1F7CXU4 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
H2-M1F7CXU4 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
H2-M1F7CXU4 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
H2-M1F7CXU4 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
H2-M1F7CXU4 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
H2-M1F7CXU4 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
H2-M1F7CXU4 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
H2-M1F7CXU4 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
H2-M1F7CXU4 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
H2-M1F7CXU4 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
H2-M1F7CXU4 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
H2-M1F7CXU4 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
H2-M1F7CXU4 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
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H2-M1F7CXU4 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
H2-M1F7CXU4 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
H2-M1F7CXU4 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
H2-M1F7CXU4 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
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